RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	PIP5K1A	Q99755	562 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	YIPF4	Q9BSR8	244 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	TBCD	Q9BTW9	1192 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	BDH2	Q9BUT1	245 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	EFCAB11	Q9BUY7	163 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	GATA5	Q9BWX5	397 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	EHD1	Q9H4M9	534 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	CALHM2	Q9HA72	323 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	OXSM	Q9NWU1	459 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	MKS1	Q9NXB0	559 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	MS4A12	Q9NXJ0	267 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	ZNF225	Q9UK10	706 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	TMCO1	Q9UM00	188 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	TNPO3	Q9Y5L0	923 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	C15orf38-AP3S2	A0A0A6YYH1	394 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	TP53I11	O14683	189 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	CASK	O14936	926 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	ITM2A	O43736	263 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	ZNF354A	O60765	605 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	LDB3	O75112	727 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	SNX4	O95219	450 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	OTC	P00480	354 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	PDYN	P01213	254 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	IGKV3-11	P04433	115 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	BPGM	P07738	259 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	FBXO45	P0C2W1	286 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	CD53	P19397	219 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	HMOX2	P30519	316 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	ARRB2	P32121	409 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	STT3A	P46977	705 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	SERPINB4	P48594	390 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	RAP1GDS1	P52306	607 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	ZNF136	P52737	540 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	IGLV3-21	P80748	117 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	PLIN5	Q00G26	463 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	HMGCS1	Q01581	520 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	BTK	Q06187	659 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	LAPTM5	Q13571	262 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	CHI3L2	Q15782	390 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	TMEM35A	Q53FP2	167 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	TNFAIP8L3	Q5GJ75	292 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	NHSL2	Q5HYW2	709 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	HHAT	Q5VTY9	493 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	LCA5	Q86VQ0	697 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	NUDCD3	Q8IVD9	361 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	P3H2	Q8IVL5	708 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	SLC22A9	Q8IVM8	553 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	TAGAP	Q8N103	731 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	NAXE	Q8NCW5	288 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	SIMC1	Q8NDZ2	872 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	LINC01560	Q8TB33	94 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	RDH11	Q8TC12	318 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	DOK4	Q8TEW6	326 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	SELENOM	Q8WWX9	145 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	TANK	Q92844	425 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	TLCD1	Q96CP7	247 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	L3HYPDH	Q96EM0	354 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	JSRP1	Q96MG2	331 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	ZFP3	Q96NJ6	502 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	DGAT2	Q96PD7	388 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	SECISBP2	Q96T21	854 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	CSF3R	Q99062	836 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	SMR3A	Q99954	134 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	PELO	Q9BRX2	385 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	DOHH	Q9BU89	302 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	MS4A8	Q9BY19	250 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	ELOVL6	Q9H5J4	265 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	PRDM7	Q9NQW5	492 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	JKAMP	Q9P055	326 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	GIMAP2	Q9UG22	337 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	CHCHD2	Q9Y6H1	151 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	NF1	P21359	2839 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	PHF3	Q92576	2039 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	LRRC3C	A6NJW4	275 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	OR6C76	A6NM76	312 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	MANBA	O00462	879 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	TRIM13	O60858	407 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	TRIM3	O75382	744 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	TRAPPC6A	O75865	159 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	SCEL	O95171	688 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	LY6G6D	O95868	133 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	HRG	P04196	525 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	HPN	P05981	417 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	CPN2	P22792	545 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	GDF1	P27539	372 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	SERPINB1	P30740	379 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	TLX1	P31314	330 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	GCK	P35557	465 aa		6.27	□□□□□ -1.41

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