RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 RAB8BQ92930 207 aa21.12■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 NEURL3Q96EH8 262 aa21.12■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP21.12■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 KCNE3Q9Y6H6 103 aa21.12■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa21.12■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 PSMG1O95456 288 aa21.12■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 CRATP43155 626 aa21.12■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 CHAF1BQ13112 559 aa21.12■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 MFSD12Q6NUT3 480 aa21.12■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 HACD2Q6Y1H2 254 aa21.12■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 RNF111Q6ZNA4 994 aa21.12■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 RAB43Q86YS6 212 aa21.12■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC15A3Q8IY34 581 aa21.12■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 HORMAD2Q8N7B1 307 aa21.12■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC16A11Q8NCK7 471 aa21.12■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 OR56A1Q8NGH5 318 aa21.12■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 SFXN5Q8TD22 340 aa21.12■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC9A6Q92581 669 aa21.12■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM125Q96AQ2 219 aa21.12■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 CLPTM1LQ96KA5 538 aa21.12■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 MS4A4EQ96PG1 132 aa21.12■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 GAL3ST4Q96RP7 486 aa21.12■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 ADA2Q9NZK5 511 aa21.12■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 NTMQ9P121 344 aa21.12■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 GYG2O15488 501 aa21.11■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 SPACA3Q8IXA5 215 aa21.11■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 OR10A6Q8NH74 314 aa21.11■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC35G5Q96KT7 338 aa21.11■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 CDRT15Q96T59 188 aa21.11■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 ITPAQ9BY32 194 aa21.11■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 FOLH1BQ9HBA9 442 aa21.11■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 COPS7AQ9UBW8 275 aa21.11■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 PEX12O00623 359 aa21.1■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 NME4O00746 187 aa21.1■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 MATN1P21941 496 aa21.1■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 OLIG3Q7RTU3 272 aa21.1■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 GALNT10Q86SR1 603 aa21.1■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 PGAM4Q8N0Y7 254 aa21.1■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM156AQ8NDB6 213 aa21.1■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 DNAJB8Q8NHS0 232 aa21.1■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 OR51I1Q9H343 314 aa21.1■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 RRP9O43818 475 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 PRAMEF2O60811 474 aa21.1■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 NPPAP01160 153 aa21.1■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 OR12D1P0DN82 309 aa21.1■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 ACP2P11117 423 aa21.1■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 RGNQ15493 299 aa21.1■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 FCRLBQ6BAA4 426 aa21.1■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 IFNEQ86WN2 208 aa21.1■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 OR7G1Q8NGA0 311 aa21.1■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 MAL2Q969L2 176 aa21.1■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 BTBD10Q9BSF8 475 aa21.1■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 EFHD1Q9BUP0 239 aa21.1■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 CHD8Q9HCK8 2581 aa21.09■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 ANKRD65E5RJM6 399 aa21.09■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 SLITRK5O94991 958 aa21.09■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 KRT75O95678 551 aa21.09■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 DUSP5Q16690 384 aa21.09■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 C16orf89Q6UX73 402 aa21.09■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 OR4N2Q8NGD1 307 aa21.09■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 PIK3R3Q92569 461 aa21.09■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 VSTM2LQ96N03 204 aa21.09■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 LMF1Q96S06 567 aa21.09■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM117AQ9C073 453 aa21.09■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 ACACAQ13085 2346 aa21.09■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 ARGFXA6NJG6 315 aa21.08■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 PDE5AO76074 875 aa21.08■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 ITGAMP11215 1152 aa21.08■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 ITPKBP27987 946 aa21.08■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 PLAG1Q6DJT9 500 aa21.08■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 NPSR1Q6W5P4 371 aa21.08■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 HSDL2Q6YN16 418 aa21.08■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 GPR155Q7Z3F1 870 aa21.08■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 C7orf57Q8NEG2 295 aa21.08■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 OR52N2Q8NGI0 321 aa21.08■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 MOAP1Q96BY2 351 aa21.08■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 VMP1Q96GC9 406 aa21.08■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 ART5Q96L15 291 aa21.08■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 THTPAQ9BU02 230 aa21.08■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 SEMA4CQ9C0C4 833 aa21.08■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 SPAG4Q9NPE6 437 aa21.08■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 DKK4Q9UBT3 224 aa21.08■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 L3MBTL1Q9Y468 752 aa21.08■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 A0A1W2PQ72 361 aa21.08■□□□□ 0.96
TSNARE1-208ENST00000524325 A8MUI8 341 aa21.08■□□□□ 0.96
TSNARE1-208ENST00000524325 EVPLLA8MZ36 301 aa21.08■□□□□ 0.96
TSNARE1-208ENST00000524325 TAF4O00268 1085 aa21.08■□□□□ 0.96
TSNARE1-208ENST00000524325 MAN1A2O60476 641 aa21.08■□□□□ 0.96
TSNARE1-208ENST00000524325 COQ9O75208 318 aa21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms