RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514702.1

HOXC-AS3-203, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 368 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-203ENST00000514702 SMYD2Q9NRG4 433 aa11.64□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 SNX12Q9UMY4 172 aa11.64□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 UQCRHLA0A096LP55 91 aa11.63□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 A0A1W2PNV4 684 aa11.63□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 A0A1W2PS29 197 aa11.63□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 PRAMEF25A6NGN4 478 aa11.63□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 DEFB108AA8MXU0 73 aa11.63□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 PLOD2O00469 737 aa11.63□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 POU2F1P14859 743 aa11.63□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 GPX3P22352 226 aa11.63□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 CNTFP26441 200 aa11.63□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 SSTR1P30872 391 aa11.63□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 DEKP35659 375 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 CD79BP40259 229 aa11.63□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 SNTA1Q13424 505 aa11.63□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 SLMAPQ14BN4 828 aa11.63□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 CTAGE3PQ8IX95 158 aa11.63□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 ADCY4Q8NFM4 1077 aa11.63□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 UBTD2Q8WUN7 234 aa11.63□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 TMCO6Q96DC7 493 aa11.63□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 PGM2Q96G03 612 aa11.63□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 UCN2Q96RP3 112 aa11.63□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 OR2B2Q9GZK3 357 aa11.63□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 EHD3Q9NZN3 535 aa11.63□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 CLCF1Q9UBD9 225 aa11.63□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 DKKL1Q9UK85 242 aa11.63□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa11.63□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 VPS13CQ709C8 3753 aa11.63□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa11.62□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 GOLGA6L10A6NI86 522 aa11.62□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 SYCE1LA8MT33 242 aa11.62□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 H0YIV9 168 aa11.62□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 KERAO60938 352 aa11.62□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 TNFSF13O75888 250 aa11.62□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 CRHP06850 196 aa11.62□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 GFAPP14136 432 aa11.62□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 CPMP14384 443 aa11.62□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 PORP16435 677 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 CRYGSP22914 178 aa11.62□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 SPRP35270 261 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 GMPRP36959 345 aa11.62□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 GP5P40197 560 aa11.62□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 PTH2RP49190 550 aa11.62□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 NEK2P51955 445 aa11.62□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 SIRPAP78324 504 aa11.62□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 DESI1Q6ICB0 168 aa11.62□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 TMEM81Q6P7N7 255 aa11.62□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa11.62□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa11.62□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 ISCA2Q86U28 154 aa11.62□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 PLCZ1Q86YW0 608 aa11.62□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 UBQLNLQ8IYU4 475 aa11.62□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 WDSUB1Q8N9V3 476 aa11.62□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 HGDQ93099 445 aa11.62□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 SERPINI1Q99574 410 aa11.62□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 ITPAQ9BY32 194 aa11.62□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 ELOVL5Q9NYP7 299 aa11.62□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 AHSPQ9NZD4 102 aa11.62□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa11.62□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 FN1P02751 2386 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 SLC22A20A6NK97 555 aa11.61□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 EFCAB8A8MWE9 144 aa11.61□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 E7ESA3 106 aa11.61□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 C16orf97H3BN30 126 aa11.61□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 ACOX3O15254 700 aa11.61□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 UGT2B11O75310 529 aa11.61□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 GUCY1B2O75343 617 aa11.61□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 REM1O75628 298 aa11.61□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 TGM6O95932 706 aa11.61□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 KLK1P06870 262 aa11.61□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 ZNF708P17019 499 aa11.61□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 SRD5A2P31213 254 aa11.61□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 KRT20P35900 424 aa11.61□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 UGT2B10P36537 528 aa11.61□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 LHX2P50458 406 aa11.61□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 GFRA1P56159 465 aa11.61□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 PFKFB4Q16877 469 aa11.61□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa11.61□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 VWA1Q6PCB0 445 aa11.61□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 PAGE2Q7Z2X7 111 aa11.61□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 ZNF550Q7Z398 422 aa11.61□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 TMEM171Q8WVE6 324 aa11.61□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 ATP6V1E2Q96A05 226 aa11.61□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 STARD4Q96DR4 205 aa11.61□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 ATOH8Q96SQ7 321 aa11.61□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-203ENST00000514702 G6PC3Q9BUM1 346 aa11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.4 ms