RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-222ENST00000514552 ART3Q13508 389 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 FAM53BQ14153 422 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 SEMA3AQ14563 771 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 RPS6KA2Q15349 733 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 MTX3Q5HYI7 312 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 WASHC2DQ5SRD0 308 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 MORN5Q5VZ52 161 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 CNSTQ6PJW8 725 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 RAD9BQ6WBX8 426 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 NEK10Q6ZWH5 1172 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 KIAA1328Q86T90 577 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 CCDC89Q8N998 374 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 SMPDL3AQ92484 453 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 NR4A3Q92570 626 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 LPGAT1Q92604 370 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 HAS2Q92819 552 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 C3orf49Q96BT1 292 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 CNDP1Q96KN2 507 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 C10orf90Q96M02 699 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF778Q96MU6 729 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 IL17FQ96PD4 163 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 NPAS1Q99742 590 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 SAYSD1Q9NPB0 183 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 ABI3Q9P2A4 366 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 TEKT2Q9UIF3 430 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 KLHL20Q9Y2M5 609 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 CSAG2Q9Y5P2 127 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 F8P00451 2351 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 HMX3A6NHT5 357 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 IDSB3KWA1 339 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 TP73O15350 636 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 NDUFS3O75489 264 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 JRKO75564 520 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 FTCDO95954 541 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 IFNB1P01574 187 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 CRYABP02511 175 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 TPSB2P20231 275 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 OGNP20774 298 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 AGAP20933 346 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 HRH2P25021 359 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 MCM3P25205 808 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 SLC26A3P40879 764 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 GRIA1P42261 906 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 OR1D4P47884 311 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 SOX2P48431 317 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 NPY2RP49146 381 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 SLC12A2P55011 1212 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
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PDE4D-222ENST00000514552 TPSAB1Q15661 275 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 GALNTL6Q49A17 601 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 CTSL3PQ5NE16 218 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF626Q68DY1 528 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 FRMPD2BQ6IN97 320 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF425Q6IV72 752 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 TMEM205Q6UW68 189 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 LINC00696Q6ZRV3 163 aa6.35□□□□□ -1.39
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PDE4D-222ENST00000514552 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 PAQR7Q86WK9 346 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 TMEM139Q8IV31 216 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 CSNK1A1LQ8N752 337 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 OR9A1PQ8NGU1 263 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 OR6Y1Q8NGX8 325 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 CFAP61Q8NHU2 1237 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 PSMF1Q92530 271 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 CABS1Q96KC9 395 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 BIRC8Q96P09 236 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 DPH7Q9BTV6 452 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 TUBB6Q9BUF5 446 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 KIFC1Q9BW19 673 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 FAM129AQ9BZQ8 928 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 TSGA10Q9BZW7 698 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 DRC3Q9H069 523 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF160Q9HCG1 818 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 CHST11Q9NPF2 352 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 CHRAC1Q9NRG0 131 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 BFARQ9NZS9 450 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 COPG2Q9UBF2 871 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF148Q9UQR1 794 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 OSGIN2Q9Y236 505 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 CACNA1DQ01668 2161 aa6.34□□□□□ -1.39
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