RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496492.5

TNIK-215, Transcript of TRAF2 and NCK interacting kinase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TNIK, Length 2,736 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIK-215ENST00000496492 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa7.13□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa7.13□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 SYT5O00445 386 aa7.13□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 MAN2B1O00754 1011 aa7.13□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 OR1F1O43749 312 aa7.13□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa7.13□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 TGM4P49221 684 aa7.13□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 MESP2Q0VG99 397 aa7.13□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 GNA13Q14344 377 aa7.13□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 ZIC1Q15915 447 aa7.13□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 FAM46CQ5VWP2 391 aa7.13□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 FAM131AQ6UXB0 335 aa7.13□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 ZNF793Q6ZN11 406 aa7.13□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 SUN3Q8TAQ9 357 aa7.13□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 RNFT2Q96EX2 444 aa7.13□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 KCTD7Q96MP8 289 aa7.13□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 FAIM2Q9BWQ8 316 aa7.13□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 SLC22A4Q9H015 551 aa7.13□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 KCNK12Q9HB15 430 aa7.13□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 TIGARQ9NQ88 270 aa7.13□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 TRPC4Q9UBN4 977 aa7.13□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 SNX7Q9UNH6 387 aa7.13□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 ZNF232Q9UNY5 417 aa7.13□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 MEIOCA2RUB1 952 aa7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 SNTNA6NMZ2 147 aa7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 UBXN7O94888 489 aa7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 TIMP1P01033 207 aa7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 FGBP02675 491 aa7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 CSF3P09919 207 aa7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 TSPAN19P0C672 248 aa7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 NR2F6P10588 404 aa7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 MYL12AP19105 171 aa7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 NTSP30990 170 aa7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 GPC1P35052 558 aa7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 TAS2R38P59533 333 aa7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 RPS25P62851 125 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 SNAPC1Q16533 368 aa7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 GAB4Q2WGN9 574 aa7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 TMEM35AQ53FP2 167 aa7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 ZNF628Q5EBL2 1059 aa7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 PPP2R2DQ66LE6 453 aa7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 C22orf42Q6IC83 251 aa7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 LINC01555Q8NAE3 123 aa7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 ZNF485Q8NCK3 441 aa7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 TTLQ8NG68 377 aa7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 TM9SF4Q92544 642 aa7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 RAB7BQ96AH8 199 aa7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 MOAP1Q96BY2 351 aa7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 CAMK1GQ96NX5 476 aa7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 ARHGDIGQ99819 225 aa7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 GDF15Q99988 308 aa7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 SOSTQ9BQB4 213 aa7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 HDAC8Q9BY41 377 aa7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 SAP130Q9H0E3 1048 aa7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 A0A087WUU8 490 aa7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 SLC30A4O14863 429 aa7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 ALPPP05187 535 aa7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 GABRA5P31644 462 aa7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 SSR2P43308 183 aa7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 SLC6A11P48066 632 aa7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 CDK3Q00526 305 aa7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 MXD1Q05195 221 aa7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 TSPAN31Q12999 210 aa7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 GPR19Q15760 415 aa7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 DDI2Q5TDH0 399 aa7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 ZNF730Q6ZMV8 503 aa7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 OLIG3Q7RTU3 272 aa7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 C7orf61Q8IZ16 206 aa7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 VWA5B2Q8N398 1253 aa7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 OR56A1Q8NGH5 318 aa7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 OR8D4Q8NGM9 314 aa7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 TEX47Q8TBZ9 253 aa7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 ING5Q8WYH8 240 aa7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 AP3S1Q92572 193 aa7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 UFD1Q92890 307 aa7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 RSPRY1Q96DX4 576 aa7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 PHOX2BQ99453 314 aa7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa7.12□□□□□ -1.27
TNIK-215ENST00000496492 KATNB1Q9BVA0 655 aa7.12□□□□□ -1.27
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