RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC30A6	Q6NXT4	461 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	RNF165	Q6ZSG1	346 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	ACAD11	Q709F0	780 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	CD163	Q86VB7	1156 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF615	Q8N8J6	731 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	OR10G3	Q8NGC4	313 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	OR9A2	Q8NGT5	310 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	CA5BP1	Q8WTZ4	195 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	PHF10	Q8WUB8	498 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	TWIST2	Q8WVJ9	160 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	ASB5	Q8WWX0	329 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	UCN3	Q969E3	161 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC120	Q96HB5	630 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	PAIP2	Q9BPZ3	127 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	ATAD3A	Q9NVI7	634 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	HEY2	Q9UBP5	337 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	TINAG	Q9UJW2	476 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	EIF3L	Q9Y262	564 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF835	Q9Y2P0	537 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	MEMO1	Q9Y316	297 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	ACTL7B	Q9Y614	415 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	POLE	Q07864	2286 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	NPIPA2	E9PIF3	369 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	NPIPA3	F8WFD2	350 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	PDPK1	O15530	556 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	PLOD3	O60568	738 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	ERN1	O75460	977 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	LYPLA1	O75608	230 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	HOXD4	P09016	255 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	LINC00032	P0C843	101 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	GABRA1	P14867	456 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	PCSK2	P16519	638 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	PTGER4	P35408	488 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	PIGA	P37287	484 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	MAGEA5	P43359	124 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	MANF	P55145	182 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	FBXW4	P57775	412 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	RAE1	P78406	368 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	MRPS35	P82673	323 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF844	Q08AG5	666 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	SNTA1	Q13424	505 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	EXOSC7	Q15024	291 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	HYAL4	Q2M3T9	481 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	CMPK2	Q5EBM0	449 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM71E1	Q6IPT2	247 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	SZRD1	Q7Z422	152 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM251	Q8N6I4	163 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	OR52N2	Q8NGI0	321 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	OR1J4	Q8NGS1	313 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	SPPL2A	Q8TCT8	520 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	AGR3	Q8TD06	166 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	KAT2A	Q92830	837 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	ADIPOR1	Q96A54	375 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	MTERF3	Q96E29	417 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	OMA1	Q96E52	524 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	LRRC46	Q96FV0	321 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	PKNOX2	Q96KN3	472 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF681	Q96N22	645 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	COL21A1	Q96P44	957 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	ITPA	Q9BY32	194 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	C12orf65	Q9H3J6	166 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	REEP4	Q9H6H4	257 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	ZDHHC11	Q9H8X9	412 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246		Q9N2J8	555 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	SDHAF3	Q9NRP4	125 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	DEPP	Q9NTK1	212 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	NKIRAS1	Q9NYS0	192 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	TAS2R7	Q9NYW3	318 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC17A7	Q9P2U7	560 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	KLF2	Q9Y5W3	355 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A087WV62	115 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	WDR91	A4D1P6	747 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	OR6C70	A6NIJ9	312 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	MYO1G	B0I1T2	1018 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	NPIPB8	E9PQR5	432 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	AQP7	O14520	342 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	WDR1	O75083	606 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	GLS	O94925	669 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	KCNH1	O95259	989 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	NADK	O95544	446 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	PRPS2	P11908	318 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	SERPINB4	P48594	390 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	PRR5	P85299	388 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	HSF1	Q00613	529 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	NNAT	Q16517	81 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	DECR1	Q16698	335 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	TRMT12	Q53H54	448 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM180B	Q6P0A1	224 aa		10.42	□□□□□ -0.74

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.6 ms