RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	AK4	P27144	223 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	SSR2	P43308	183 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	RPL5	P46777	297 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	FASLG	P48023	281 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	ALDH3B2	P48448	385 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	HMGA2	P52926	109 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	DSTN	P60981	165 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	SELENOW	P63302	87 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	CYP4F2	P78329	520 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	KCNJ10	P78508	379 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	CDK6	Q00534	326 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	TFF2	Q03403	129 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	RGS1	Q08116	209 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	SCARB2	Q14108	478 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC9A5	Q14940	896 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	C16orf72	Q14CZ0	275 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	MAPK11	Q15759	364 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	LIN52	Q52LA3	116 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	CHCHD2P9	Q5T1J5	151 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	NDUFAF5	Q5TEU4	345 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	TTC23	Q5W5X9	447 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	OR2T5	Q6IEZ7	315 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC48A1	Q6P1K1	146 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	FBXO42	Q6P3S6	717 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	FAHD1	Q6P587	224 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	TBPL2	Q6SJ96	375 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	TSEN54	Q7Z6J9	526 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	ASPG	Q86U10	573 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	C11orf74	Q86VG3	221 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	PARG	Q86W56	976 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	ARMC8	Q8IUR7	673 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	ZDHHC21	Q8IVQ6	265 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	SAMD14	Q8IZD0	417 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	MMP21	Q8N119	569 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	DHRSX	Q8N5I4	330 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	AMER3	Q8N944	861 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	ACOT4	Q8N9L9	421 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	TSTD1	Q8NFU3	115 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	OR2T29	Q8NH02	315 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	CCL4L1	Q8NHW4	92 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	CDC26	Q8NHZ8	85 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	PNPT1	Q8TCS8	783 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	HMGB4	Q8WW32	186 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	NCSTN	Q92542	709 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	CIDEC	Q96AQ7	238 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	C10orf90	Q96M02	699 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	CNBD2	Q96M20	576 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF681	Q96N22	645 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	AMDHD1	Q96NU7	426 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF347	Q96SE7	839 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	EPYC	Q99645	322 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	SMAD5	Q99717	465 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	SORBS1	Q9BX66	1292 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	SRMS	Q9H3Y6	488 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	KLHL31	Q9H511	634 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	SYNPO2L	Q9H987	977 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	BCL2L10	Q9HD36	194 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC35C2	Q9NQQ7	365 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	DDX18	Q9NVP1	670 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	ADPRHL2	Q9NX46	363 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	TEX10	Q9NXF1	929 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	SPAST	Q9UBP0	616 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	APOBEC3B	Q9UH17	382 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	C3orf18	Q9UK00	162 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	UTS2R	Q9UKP6	389 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	CA5B	Q9Y2D0	317 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	PCDHGB5	Q9Y5G0	923 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	HSPE1-MOB4	S4R3N1	261 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	SZT2	Q5T011	3432 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A0J9YY10	115 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A1W2PR48	441 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	OR5K3	A6NET4	321 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	URAD	A6NGE7	173 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	LILRA5	A6NI73	299 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	C2orf74	A8MZ97	194 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	ISM1	B1AKI9	464 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	ERI3	O43414	337 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	SUV39H1	O43463	412 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	PROM1	O43490	865 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	ASNA1	O43681	348 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	CTSV	O60911	334 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	SH3BGRL	O75368	114 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	JRK	O75564	520 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	DNAJB5	O75953	348 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	AIFM1	O95831	613 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	VIP	P01282	170 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	CSF2	P04141	144 aa		5.21	□□□□□ -1.58

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