RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PRAME-212ENST00000485532 TRPC4APQ8TEL6 797 aa11.57□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 REPS1Q96D71 796 aa11.57□□□□□ -0.56
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