RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482558.5

SNX13-208, Transcript of sorting nexin 13, humanhuman

TSL 2

Gene SNX13, Length 1,139 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13-208ENST00000482558 ITGA2P17301 1181 aa7.3□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 ENGP17813 658 aa7.3□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 ACADLP28330 430 aa7.3□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 KDELR2P33947 212 aa7.3□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 RYKP34925 604 aa7.3□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 BSGP35613 385 aa7.3□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 CAPZA2P47755 286 aa7.3□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 ARFIP1P53367 373 aa7.3□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 CXCR4P61073 352 aa7.3□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 NTHL1P78549 312 aa7.3□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 PPP2R2BQ00005 443 aa7.3□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 FCHO2Q0JRZ9 810 aa7.3□□□□□ -1.24
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SNX13-208ENST00000482558 ZNF234Q14588 700 aa7.3□□□□□ -1.24
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SNX13-208ENST00000482558 OR4F3Q6IEY1 312 aa7.3□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 OR2T5Q6IEZ7 315 aa7.3□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 TRIM40Q6P9F5 258 aa7.3□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 ZNF773Q6PK81 442 aa7.3□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 DOK6Q6PKX4 331 aa7.3□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 ZNF621Q6ZSS3 439 aa7.3□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 TMEM26Q6ZUK4 368 aa7.3□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 GLRX5Q86SX6 157 aa7.3□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 AMZ2Q86W34 360 aa7.3□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 CCDC28AQ8IWP9 274 aa7.3□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 TMEFF1Q8IYR6 380 aa7.3□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 SYT8Q8NBV8 401 aa7.3□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 C11orf65Q8NCR3 313 aa7.3□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 TTLQ8NG68 377 aa7.3□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 OR2T29Q8NH02 315 aa7.3□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 HUS1BQ8NHY5 278 aa7.3□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 ZNF480Q8WV37 535 aa7.3□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 SORCS1Q8WY21 1168 aa7.3□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 ING5Q8WYH8 240 aa7.3□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 LZICQ8WZA0 190 aa7.3□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 ARRDC3Q96B67 414 aa7.3□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 COX14Q96I36 57 aa7.3□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 ZNF347Q96SE7 839 aa7.3□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 BCL7BQ9BQE9 202 aa7.3□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa7.3□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 OR2AG1Q9H205 316 aa7.3□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 TPT1P8Q9HAU6 139 aa7.3□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 MYNNQ9NPC7 610 aa7.3□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 SNTG1Q9NSN8 517 aa7.3□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 SELENONQ9NZV5 590 aa7.3□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 CEPT1Q9Y6K0 416 aa7.3□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 MYOFQ9NZM1 2061 aa7.29□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 A8MVJ9 347 aa7.29□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 FAM25EA8MYX2 175 aa7.29□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 PCDH7O60245 1069 aa7.29□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 NOBOXO60393 691 aa7.29□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 TRMUO75648 421 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 KCNK5O95279 499 aa7.29□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 SNAP29O95721 258 aa7.29□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 SOD1P00441 154 aa7.29□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 PNPP00491 289 aa7.29□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 APODP05090 189 aa7.29□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 FABP3P05413 133 aa7.29□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 ERGP11308 486 aa7.29□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 PCNAP12004 261 aa7.29□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 CD22P20273 847 aa7.29□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 FPR1P21462 350 aa7.29□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 IDSP22304 550 aa7.29□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 PCGF2P35227 344 aa7.29□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 TNFRSF4P43489 277 aa7.29□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 WNT3P56703 355 aa7.29□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 TBPL1P62380 186 aa7.29□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 PRR5P85299 388 aa7.29□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 TAP2Q03519 686 aa7.29□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 PLP2Q04941 152 aa7.29□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 DMPKQ09013 629 aa7.29□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 RUNX3Q13761 415 aa7.29□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 PDE7AQ13946 482 aa7.29□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 KEAP1Q14145 624 aa7.29□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 PNCKQ6P2M8 343 aa7.29□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa7.29□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa7.29□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 SYT13Q7L8C5 426 aa7.29□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 TMPRSS11BQ86T26 416 aa7.29□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 C17orf64Q86WR6 236 aa7.29□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 CROCCP3Q8IVE0 287 aa7.29□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa7.29□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 METTL4Q8N3J2 472 aa7.29□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 TBC1D19Q8N5T2 526 aa7.29□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 METTL25Q8N6Q8 603 aa7.29□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 POGLUT1Q8NBL1 392 aa7.29□□□□□ -1.24
SNX13-208ENST00000482558 CLHC1Q8NHS4 586 aa7.29□□□□□ -1.24
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