RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480420.5

CTPS1-209, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-209ENST00000480420 TBCELQ5QJ74 424 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF678Q5SXM1 525 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-209ENST00000480420 CES4AQ5XG92 561 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-209ENST00000480420 RTL6Q6ICC9 239 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-209ENST00000480420 SLC48A1Q6P1K1 146 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-209ENST00000480420 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-209ENST00000480420 LIX1LQ8IVB5 337 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-209ENST00000480420 ZZZ3Q8IYH5 903 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-209ENST00000480420 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF615Q8N8J6 731 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-209ENST00000480420 OR7G1Q8NGA0 311 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-209ENST00000480420 OR1J4Q8NGS1 313 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-209ENST00000480420 OR9A2Q8NGT5 310 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-209ENST00000480420 OR14L1PQ8NHC6 308 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-209ENST00000480420 NEIL3Q8TAT5 605 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-209ENST00000480420 SPPL2AQ8TCT8 520 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-209ENST00000480420 OMA1Q96E52 524 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-209ENST00000480420 EPB41L4BQ9H329 900 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-209ENST00000480420 PROK2Q9HC23 129 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-209ENST00000480420 MCCC2Q9HCC0 563 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-209ENST00000480420 GALNT9Q9HCQ5 603 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-209ENST00000480420 SERHLQ9NQF3 203 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-209ENST00000480420 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-209ENST00000480420 PSD3Q9NYI0 1048 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-209ENST00000480420 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-209ENST00000480420 HEY2Q9UBP5 337 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-209ENST00000480420 CFL2Q9Y281 166 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-209ENST00000480420 DTX4Q9Y2E6 619 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-209ENST00000480420 PLLPQ9Y342 182 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-209ENST00000480420 OR10H1Q9Y4A9 318 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-209ENST00000480420 PDZD2O15018 2839 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 MED12Q93074 2177 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 A0A1B0GVC2 190 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 A0A1W2PPM1 405 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 TLDC2A0PJX2 215 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 DVL2O14641 736 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 GMFGO60234 142 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 PPM1BO75688 479 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 SNX4O95219 450 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 IL2RAP01589 272 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 SBK3P0C264 359 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 IMPDH1P20839 514 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 MSX1P28360 303 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 GALNSP34059 522 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 CASP3P42574 277 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 LCP2Q13094 533 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 STX5Q13190 355 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 GGTA1PQ4G0N0 100 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 OR5M10Q6IEU7 315 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 PPP4R4Q6NUP7 873 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 ADGRD1Q6QNK2 874 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 SZRD1Q7Z422 152 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 SLC22A9Q8IVM8 553 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 ULK2Q8IYT8 1036 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 TNIP2Q8NFZ5 429 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 C16orf78Q8WTQ4 265 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 NRGNQ92686 78 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 TMBIM1Q969X1 311 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 ISL2Q96A47 359 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 ADIPOR1Q96A54 375 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 TP53INP1Q96A56 240 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 LRRC46Q96FV0 321 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 APIPQ96GX9 242 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 NODALQ96S42 347 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF382Q96SR6 550 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 ADOQ96SZ5 270 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 OSBPL11Q9BXB4 747 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 FUT8Q9BYC5 575 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 ACPTQ9BZG2 426 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 ENKD1Q9H0I2 346 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 BRF2Q9HAW0 419 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 SH2D2AQ9NP31 389 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 MIEF1Q9NQG6 463 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 MAT2BQ9NZL9 334 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 PRODH2Q9UF12 536 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF225Q9UK10 706 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 DKKL1Q9UK85 242 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 MPDZO75970 2070 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 DCHS2Q6V1P9 2916 aa7.38□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 PRAMEF25A6NGN4 478 aa7.38□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 HSPB2A8KAH6 182 aa7.38□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa7.38□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 H0Y3Z8 333 aa7.38□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 SCO2O43819 266 aa7.38□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 ICOSLGO75144 302 aa7.38□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 UGT2B11O75310 529 aa7.38□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 JUNP05412 331 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 ABHD2P08910 425 aa7.38□□□□□ -1.23
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