RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462494.5

ACTB-207, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 2,245 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-207ENST00000462494 PKLRP30613 574 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 TIE1P35590 1138 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 TAS2R41P59536 307 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 HYAL2Q12891 473 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 NDUFA9Q16795 377 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 ATAT1Q5SQI0 421 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 ABHD17CQ6PCB6 329 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 PHC2Q8IXK0 858 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 FBXL6Q8N531 539 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 FLCNQ8NFG4 579 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 OR2L8Q8NGY9 312 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 TXNDC15Q96J42 360 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 C3orf14Q9HBI5 128 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 TMEM165Q9HC07 324 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 BCL2L10Q9HD36 194 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 PRDM7Q9NQW5 492 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 GPR52Q9Y2T5 361 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 ASNA1O43681 348 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 TRIM23P36406 574 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 SMSP52788 366 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 RUNX1T1Q06455 604 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 MAP4K2Q12851 820 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 SGCGQ13326 291 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 RUNX3Q13761 415 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 GNA13Q14344 377 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 KCNJ8Q15842 424 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 ZIC1Q15915 447 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 ZNF311Q5JNZ3 666 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 C1orf94Q6P1W5 598 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 KIF18BQ86Y91 864 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 LAX1Q8IWV1 398 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 SLC9A6Q92581 669 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 RACGAP1Q9H0H5 632 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 SPHK1Q9NYA1 384 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 SLC13A4Q9UKG4 626 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 DNAH14Q0VDD8 3507 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 A0A0G2JPF8 293 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 HYKKA2RU49 373 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 A8MU76 341 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 CDRT1O95170 752 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 SNX4O95219 450 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 NTN1O95631 604 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 FHP07954 510 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 MC3RP41968 323 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 MAGEA8P43361 318 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 DMPKQ09013 629 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 LRRC32Q14392 662 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 ZMAT1Q5H9K5 638 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 CD300LDQ6UXZ3 194 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 VRK2Q86Y07 508 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 ZG16BQ96DA0 208 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 GPR89AB7ZAQ6 455 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 C5orf67F2Z3F1 127 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 PLD2O14939 933 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 GPR89BP0CG08 455 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 MYL12AP19105 171 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 SOX9P48436 509 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 MAN2A2P49641 1150 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 CDK5Q00535 292 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 TMEM64Q6YI46 380 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 LINC00471Q8N535 108 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 OR2L5Q8NG80 312 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 OR2L3Q8NG85 312 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 OR56A1Q8NGH5 318 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 OR9A2Q8NGT5 310 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 TEX47Q8TBZ9 253 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 OR7D2Q96RA2 312 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 NELL2Q99435 816 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 CCDC32Q9BV29 185 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 PINK1Q9BXM7 581 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 CERS4Q9HA82 394 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 CNIH4Q9P003 139 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 POU2F3Q9UKI9 436 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 XIRP2A4UGR9 3374 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 A0A087WUU8 490 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 GUCY1B2O75343 617 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 CEACAM5P06731 702 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 POU2F2P09086 479 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 TSPAN19P0C672 248 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 PRR5P85299 388 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.5 ms