RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452979.5

HERC3-207, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 3

Gene HERC3, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-207ENST00000452979 TYK2P29597 1187 aa10.64□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 SSTR4P31391 388 aa10.64□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 BSGP35613 385 aa10.64□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 RAP1GDS1P52306 607 aa10.64□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 NAGLUP54802 743 aa10.64□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 RPP38P78345 283 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 FUT7Q11130 342 aa10.64□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 FOXF2Q12947 444 aa10.64□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 CUL3Q13618 768 aa10.64□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP10.64□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 EIPR1Q53HC9 387 aa10.64□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 DCST1Q5T197 706 aa10.64□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 BICRALQ6AI39 1079 aa10.64□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 TMEM81Q6P7N7 255 aa10.64□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 TMEM64Q6YI46 380 aa10.64□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 RAPH1Q70E73 1250 aa10.64□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa10.64□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa10.64□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 RNF175Q8N4F7 328 aa10.64□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 C9orf106Q8NAJ2 232 aa10.64□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 C17orf47Q8NEP4 570 aa10.64□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 UBTD2Q8WUN7 234 aa10.64□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 KCTD4Q8WVF5 259 aa10.64□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 PGM2Q96G03 612 aa10.64□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 PIP5K1AQ99755 562 aa10.64□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 CENPKQ9BS16 269 aa10.64□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 NUDT4Q9NZJ9 180 aa10.64□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 RNF112Q9ULX5 631 aa10.64□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa10.63□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 H0YIV9 168 aa10.63□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 ARHGEF9O43307 516 aa10.63□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 TMPRSS11DO60235 418 aa10.63□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 ERN1O75460 977 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 EEDO75530 441 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 LY6G6DO95868 133 aa10.63□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 PYGBP11216 843 aa10.63□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 CREB1P16220 341 aa10.63□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 EPB42P16452 691 aa10.63□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 NAGAP17050 411 aa10.63□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 CRABP2P29373 138 aa10.63□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 SOX18P35713 384 aa10.63□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 MASP1P48740 699 aa10.63□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 PCYT1AP49585 367 aa10.63□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 TMED10P49755 219 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 NRG3P56975 720 aa10.63□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 RCAN2Q14206 197 aa10.63□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 SETDB1Q15047 1291 aa10.63□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 LGSNQ5TDP6 509 aa10.63□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa10.63□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 LIPJQ5W064 366 aa10.63□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 C4orf33Q8N1A6 199 aa10.63□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 UCN3Q969E3 161 aa10.63□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 ARL8AQ96BM9 186 aa10.63□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 ZFP3Q96NJ6 502 aa10.63□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 GPR78Q96P69 363 aa10.63□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 ATOH8Q96SQ7 321 aa10.63□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 TM9SF2Q99805 663 aa10.63□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 SFXN3Q9BWM7 321 aa10.63□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 OR10A5Q9H207 317 aa10.63□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 VPS11Q9H270 941 aa10.63□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 TMBIM4Q9HC24 238 aa10.63□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 GALNT8Q9NY28 637 aa10.63□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 OPTCQ9UBM4 332 aa10.63□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa10.63□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 FBN3Q75N90 2809 aa10.62□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 A0A087X1B8 175 aa10.62□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 SH3D21A4FU49 640 aa10.62□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 GLOD5A6NK44 160 aa10.62□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 PGRMC2O15173 223 aa10.62□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 KERAO60938 352 aa10.62□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 CT62P0C5K7 136 aa10.62□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 FAM58BPP0C7Q3 252 aa10.62□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 MYZAPP0CAP1 466 aa10.62□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 NR2F6P10588 404 aa10.62□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 CYP4B1P13584 511 aa10.62□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 KRT4P19013 534 aa10.62□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 ABCD3P28288 659 aa10.62□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 RPS13P62277 151 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 POU4F3Q15319 338 aa10.62□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 TOMM20Q15388 145 aa10.62□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 TTMPQ5BVD1 217 aa10.62□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa10.62□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 CYP20A1Q6UW02 462 aa10.62□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 PRSS57Q6UWY2 283 aa10.62□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 NUP54Q7Z3B4 507 aa10.62□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 PRIMA1Q86XR5 153 aa10.62□□□□□ -0.71
HERC3-207ENST00000452979 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms