RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452576.6

VWDE-203, Transcript of von Willebrand factor D and EGF domains, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene VWDE, Length 5,936 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDE-203ENST00000452576 TTYH3Q9C0H2 523 aa11.7□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 TEX264Q9Y6I9 313 aa11.7□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 FEZF1A0PJY2 475 aa11.69□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 PHYHO14832 338 aa11.69□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 VEGFDO43915 354 aa11.69□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 SLC22A5O76082 557 aa11.69□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 KCNC1P48547 511 aa11.69□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa11.69□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 FIGNL1Q6PIW4 674 aa11.69□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 OR4K13Q8NH42 304 aa11.69□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 C16orf78Q8WTQ4 265 aa11.69□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 SLC41A3Q96GZ6 507 aa11.69□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 SHDQ96IW2 340 aa11.69□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 HS6ST2Q96MM7 605 aa11.69□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 SOBPA7XYQ1 873 aa11.69□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 INHAP05111 366 aa11.69□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 RPS17P08708 135 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 WDR45BQ5MNZ6 344 aa11.69□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 PLBD1Q6P4A8 553 aa11.69□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 C3P1Q6ZMU1 363 aa11.69□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 OR8J1Q8NGP2 316 aa11.69□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 TSPEARQ8WU66 669 aa11.69□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 FAM118AQ9NWS6 357 aa11.69□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa11.69□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 CHD1O14646 1710 aa11.69□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 OR6C65A6NJZ3 312 aa11.69□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 CERS1P27544 350 aa11.69□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 GRB7Q14451 532 aa11.69□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 PTPRRQ15256 657 aa11.69□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 C6orf136Q5SQH8 315 aa11.69□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 GPR155Q7Z3F1 870 aa11.69□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 ELMOD3Q96FG2 381 aa11.69□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 GLTPD2A6NH11 291 aa11.69□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 RPP30P78346 268 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 NPRL3Q12980 569 aa11.69□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 FAM214AQ32MH5 1076 aa11.69□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 MS4A13Q5J8X5 152 aa11.69□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 MPP7Q5T2T1 576 aa11.69□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 FCRLBQ6BAA4 426 aa11.69□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 ACBD7Q8N6N7 88 aa11.69□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 BEST4Q8NFU0 473 aa11.69□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 OR51D1Q8NGF3 324 aa11.69□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 OR8K5Q8NH50 307 aa11.69□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 SLC2A12Q8TD20 617 aa11.69□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 PLEKHO2Q8TD55 490 aa11.69□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 ZNF516Q92618 1163 aa11.69□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 SYT17Q9BSW7 474 aa11.69□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 KCNK12Q9HB15 430 aa11.69□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 GPR52Q9Y2T5 361 aa11.69□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 VSTM2BA6NLU5 285 aa11.68□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 ARAFP10398 606 aa11.68□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 RHCEP18577 417 aa11.68□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 SLC22A10Q63ZE4 541 aa11.68□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 PNCKQ6P2M8 343 aa11.68□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 SUMF2Q8NBJ7 301 aa11.68□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 TMEM185AQ8NFB2 350 aa11.68□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 FNDC8Q8TC99 324 aa11.68□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 SLC35F5Q8WV83 523 aa11.68□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 ZFAND2BQ8WV99 257 aa11.68□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 KLHL13Q9P2N7 655 aa11.68□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 B4GALT6Q9UBX8 382 aa11.68□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 CD300AQ9UGN4 299 aa11.68□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 ATG4BQ9Y4P1 393 aa11.68□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 SOWAHBA6NEL2 793 aa11.68□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 SYT7O43581 403 aa11.68□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 CNTN5O94779 1100 aa11.68□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 ALDOBP05062 364 aa11.68□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 PRMT2P55345 433 aa11.68□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 ELOCQ15369 112 aa11.68□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 CMTM1Q8IZ96 169 aa11.68□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 ZNF559Q9BR84 538 aa11.68□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 KCNJ16Q9NPI9 418 aa11.68□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 VWDEQ8N2E2 1590 aa11.68□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa11.68□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 CA12O43570 354 aa11.68□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 UGT2B7P16662 529 aa11.68□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP11.68□□□□□ -0.545e-7■■■□□ 19.2
VWDE-203ENST00000452576 BMXP51813 675 aa11.68□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 DEFB134Q4QY38 66 aa11.68□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 ZNF382Q96SR6 550 aa11.68□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 CCDC106Q9BWC9 280 aa11.68□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 FUNDC2Q9BWH2 189 aa11.68□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 SMOC2Q9H3U7 446 aa11.68□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 SCML2Q9UQR0 700 aa11.68□□□□□ -0.54
VWDE-203ENST00000452576 SULT1C2O00338 296 aa11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms