RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449504.5

HDLBP-222, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-222ENST00000449504 CLPSP04118 112 aa6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 TPM1P09493 284 aa6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 PEPDP12955 493 aa6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 APEHP13798 732 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 EPB42P16452 691 aa6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 GNAZP19086 355 aa6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 ABCD3P28288 659 aa6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 SRD5A2P31213 254 aa6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 PTGDSP41222 190 aa6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 GDF5P43026 501 aa6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 KCNC1P48547 511 aa6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 CTBP2P56545 445 aa6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 IL2P60568 153 aa6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 BSPH1Q075Z2 132 aa6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 ZNF844Q08AG5 666 aa6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 SLAMF1Q13291 335 aa6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 OASLQ15646 514 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 BCL2A1Q16548 175 aa6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 SGCBQ16585 318 aa6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 AP5B1Q2VPB7 878 aa6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 ADPRMQ3LIE5 342 aa6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 AGAP6Q5VW22 663 aa6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 C18orf63Q68DL7 685 aa6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 NUP54Q7Z3B4 507 aa6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 VN1R5Q7Z5H4 357 aa6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 UBE3DQ7Z6J8 389 aa6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 PLCZ1Q86YW0 608 aa6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 SNX31Q8N9S9 440 aa6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 BBOF1Q8ND07 529 aa6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 C7orf57Q8NEG2 295 aa6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 C10orf105Q8TEF2 133 aa6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 PROX1Q92786 737 aa6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 S100PBPQ96BU1 408 aa6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 KCNC2Q96PR1 638 aa6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 EGFL8Q99944 293 aa6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 ROGDIQ9GZN7 287 aa6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 TAS2R13Q9NYV9 303 aa6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 FBXL2Q9UKC9 423 aa6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 FBXO5Q9UKT4 447 aa6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 GPR52Q9Y2T5 361 aa6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 EMC9Q9Y3B6 208 aa6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 ROS1P08922 2347 aa6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 TGP01266 2768 aa6.42□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa6.42□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 DPRXA6NFQ7 191 aa6.42□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 PRAMEF25A6NGN4 478 aa6.42□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 GLOD5A6NK44 160 aa6.42□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 EFCAB8A8MWE9 144 aa6.42□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 ZIC3O60481 467 aa6.42□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 TNFRSF21O75509 655 aa6.42□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 LY6HO94772 140 aa6.42□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 AQP8O94778 261 aa6.42□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 TGFB1P01137 390 aa6.42□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 RHOXF2BP0C7M4 288 aa6.42□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 GSTM2P28161 218 aa6.42□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 SSR2P43308 183 aa6.42□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 CDKN2DP55273 166 aa6.42□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 CDH11P55287 796 aa6.42□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 CLDN15P56746 228 aa6.42□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 IRF9Q00978 393 aa6.42□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 BIKQ13323 160 aa6.42□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 CARTPTQ16568 116 aa6.42□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 SPRED3Q2MJR0 410 aa6.42□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 PRR31Q5SQ13 230 aa6.42□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 BEND4Q6ZU67 534 aa6.42□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 DTX2Q86UW9 622 aa6.42□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 STK32CQ86UX6 486 aa6.42□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 MED12LQ86YW9 2145 aa6.42□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 UBL4BQ8N7F7 174 aa6.42□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 STEAP2Q8NFT2 490 aa6.42□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 OR5M1Q8NGP8 315 aa6.42□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 OR6K3Q8NGY3 331 aa6.42□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 TANKQ92844 425 aa6.42□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 ADIPOR1Q96A54 375 aa6.42□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 OMA1Q96E52 524 aa6.42□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 VPS39Q96JC1 886 aa6.42□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 TBCDQ9BTW9 1192 aa6.42□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 PRR14Q9BWN1 585 aa6.42□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 TRIM2Q9C040 744 aa6.42□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 OR10A5Q9H207 317 aa6.42□□□□□ -1.38
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