RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426951.5

RBM39-211, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RBM39, Length 840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-211ENST00000426951 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa3.22□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 C1orf186Q6ZWK4 172 aa3.22□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 GPD1LQ8N335 351 aa3.22□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 SPEM1Q8N4L4 309 aa3.22□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 CD177Q8N6Q3 437 aa3.22□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 LRRC17Q8N6Y2 441 aa3.22□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa3.22□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 PHYHIPQ92561 330 aa3.22□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 LHX4Q969G2 390 aa3.22□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 FAM173AQ9BQD7 235 aa3.22□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 CBWD1Q9BRT8 395 aa3.22□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 SYTL2Q9HCH5 934 aa3.22□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 HOMER3Q9NSC5 361 aa3.22□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 CENPMQ9NSP4 180 aa3.22□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 PRODH2Q9UF12 536 aa3.22□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 MIOXQ9UGB7 285 aa3.22□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 DNPEPQ9ULA0 475 aa3.22□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 KNSTRNQ9Y448 316 aa3.22□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 A0A0J9YVX5 310 aa3.21□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 ZBTB14O43829 449 aa3.21□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 ECDO95905 644 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 IGHV3-9P01782 118 aa3.21□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 SLC4A1P02730 911 aa3.21□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 ZCCHC18P0CG32 403 aa3.21□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 VDRP11473 427 aa3.21□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 CYP11B1P15538 503 aa3.21□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 TMOD1P28289 359 aa3.21□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 NME3Q13232 169 aa3.21□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 WDR88Q6ZMY6 472 aa3.21□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 STOX1Q6ZVD7 989 aa3.21□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa3.21□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 AMZ2Q86W34 360 aa3.21□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 FBXL16Q8N461 479 aa3.21□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa3.21□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 OR4F17Q8NGA8 305 aa3.21□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 OR52J3Q8NH60 311 aa3.21□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 OR4F4Q96R69 305 aa3.21□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 NACA2Q9H009 215 aa3.21□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 TIGARQ9NQ88 270 aa3.21□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP3.21□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 RAI14Q9P0K7 980 aa3.21□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 KCNN3Q9UGI6 736 aa3.21□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 IL19Q9UHD0 177 aa3.21□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 MOSPD1Q9UJG1 213 aa3.21□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa3.21□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa3.2□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 NPIPA5E9PKD4 350 aa3.2□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 H3BMH7 237 aa3.2□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 PRAMEF12O95522 483 aa3.2□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 PGK2P07205 417 aa3.2□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 WNT2P09544 360 aa3.2□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 SGSHP51688 502 aa3.2□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 ZNF85Q03923 595 aa3.2□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 ZNF33BQ06732 778 aa3.2□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 WASHC5Q12768 1159 aa3.2□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 MICAQ29983 383 aa3.2□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 AGKQ53H12 422 aa3.2□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 MS4A13Q5J8X5 152 aa3.2□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 MARC1Q5VT66 337 aa3.2□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 OR6B2Q6IFH4 312 aa3.2□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 ATRAIDQ6UW56 229 aa3.2□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa3.2□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 TAF8Q7Z7C8 310 aa3.2□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa3.2□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 FTHL17Q9BXU8 183 aa3.2□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 TRIM9Q9C026 710 aa3.2□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 ABCG8Q9H221 673 aa3.2□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 TSPY26PQ9H489 355 aa3.2□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 ALG9Q9H6U8 611 aa3.2□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 DBNDD1Q9H9R9 158 aa3.2□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 PRR34Q9NV39 138 aa3.2□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 ANO10Q9NW15 660 aa3.2□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 VSIG4Q9Y279 399 aa3.2□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 ZMYM6O95789 1325 aa3.19□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 CFAP73A6NFT4 308 aa3.19□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 MFSD2BA6NFX1 497 aa3.19□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 ARHGAP42A6NI28 874 aa3.19□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 EFCAB7A8K855 629 aa3.19□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 ADAM12O43184 909 aa3.19□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 SDC3O75056 442 aa3.19□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 IGKV3-15P01624 115 aa3.19□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 CXCL10P02778 98 aa3.19□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 PVRP15151 417 aa3.19□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 ACP1P24666 158 aa3.19□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 PRDX6P30041 224 aa3.19□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 AKT2P31751 481 aa3.19□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 SFNP31947 248 aa3.19□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 HSPA1LP34931 641 aa3.19□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 MAGEA4P43358 317 aa3.19□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 NOP14P78316 857 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 PAX2Q02962 417 aa3.19□□□□□ -1.9
RBM39-211ENST00000426951 BNIP1Q12981 228 aa3.19□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.9 ms