RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426683.5

HERC3-205, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC3, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-205ENST00000426683 OR2M7Q8NG81 312 aa16.61■□□□□ 0.25
HERC3-205ENST00000426683 OR10G3Q8NGC4 313 aa16.61■□□□□ 0.25
HERC3-205ENST00000426683 OR5M3Q8NGP4 307 aa16.61■□□□□ 0.25
HERC3-205ENST00000426683 PAQR8Q8TEZ7 354 aa16.61■□□□□ 0.25
HERC3-205ENST00000426683 MTERF3Q96E29 417 aa16.61■□□□□ 0.25
HERC3-205ENST00000426683 GPR137Q96N19 417 aa16.61■□□□□ 0.25
HERC3-205ENST00000426683 SH2D2AQ9NP31 389 aa16.61■□□□□ 0.25
HERC3-205ENST00000426683 NBASA2RRP1 2371 aa16.6■□□□□ 0.25
HERC3-205ENST00000426683 A0A087WV62 115 aa16.6■□□□□ 0.25
HERC3-205ENST00000426683 PLOD2O00469 737 aa16.6■□□□□ 0.25
HERC3-205ENST00000426683 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
HERC3-205ENST00000426683 COQ9O75208 318 aa16.6■□□□□ 0.25
HERC3-205ENST00000426683 G6PDP11413 515 aa16.6■□□□□ 0.25
HERC3-205ENST00000426683 DDX5P17844 614 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
HERC3-205ENST00000426683 DRD5P21918 477 aa16.6■□□□□ 0.25
HERC3-205ENST00000426683 ABCD3P28288 659 aa16.6■□□□□ 0.25
HERC3-205ENST00000426683 PIGAP37287 484 aa16.6■□□□□ 0.25
HERC3-205ENST00000426683 RPL3P39023 403 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
HERC3-205ENST00000426683 PPICP45877 212 aa16.6■□□□□ 0.25
HERC3-205ENST00000426683 DNASE1L1P49184 302 aa16.6■□□□□ 0.25
HERC3-205ENST00000426683 TMED10P49755 219 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
HERC3-205ENST00000426683 FBXW4P57775 412 aa16.6■□□□□ 0.25
HERC3-205ENST00000426683 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP16.6■□□□□ 0.25
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HERC3-205ENST00000426683 RPS6KA2Q15349 733 aa16.6■□□□□ 0.25
HERC3-205ENST00000426683 SMU1Q2TAY7 513 aa16.6■□□□□ 0.25
HERC3-205ENST00000426683 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
HERC3-205ENST00000426683 SIAH3Q8IW03 269 aa16.6■□□□□ 0.25
HERC3-205ENST00000426683 FAM26EQ8N5C1 309 aa16.6■□□□□ 0.25
HERC3-205ENST00000426683 ZFP28Q8NHY6 868 aa16.6■□□□□ 0.25
HERC3-205ENST00000426683 ELP4Q96EB1 424 aa16.6■□□□□ 0.25
HERC3-205ENST00000426683 HSPBAP1Q96EW2 488 aa16.6■□□□□ 0.25
HERC3-205ENST00000426683 MAGED4Q96JG8 741 aa16.6■□□□□ 0.25
HERC3-205ENST00000426683 FAM173AQ9BQD7 235 aa16.6■□□□□ 0.25
HERC3-205ENST00000426683 TAS2R9Q9NYW1 312 aa16.6■□□□□ 0.25
HERC3-205ENST00000426683 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
HERC3-205ENST00000426683 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
HERC3-205ENST00000426683 ATP6V1HQ9UI12 483 aa16.6■□□□□ 0.25
HERC3-205ENST00000426683 OSGIN2Q9Y236 505 aa16.6■□□□□ 0.25
HERC3-205ENST00000426683 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
HERC3-205ENST00000426683 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
HERC3-205ENST00000426683 FRG2CA6NGY1 282 aa16.59■□□□□ 0.25
HERC3-205ENST00000426683 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
HERC3-205ENST00000426683 TP53I11O14683 189 aa16.59■□□□□ 0.25
HERC3-205ENST00000426683 TFECO14948 347 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
HERC3-205ENST00000426683 ACOX3O15254 700 aa16.59■□□□□ 0.25
HERC3-205ENST00000426683 HS6ST1O60243 411 aa16.59■□□□□ 0.25
HERC3-205ENST00000426683 SASH3O75995 380 aa16.59■□□□□ 0.25
HERC3-205ENST00000426683 KITP10721 976 aa16.59■□□□□ 0.25
HERC3-205ENST00000426683 GPC1P35052 558 aa16.59■□□□□ 0.25
HERC3-205ENST00000426683 OCRLQ01968 901 aa16.59■□□□□ 0.25
HERC3-205ENST00000426683 PLGLB1Q02325 96 aa16.59■□□□□ 0.25
HERC3-205ENST00000426683 PLCXD2Q0VAA5 305 aa16.59■□□□□ 0.25
HERC3-205ENST00000426683 KRTCAP3Q53RY4 240 aa16.59■□□□□ 0.25
HERC3-205ENST00000426683 PRAMEF20Q5VT98 475 aa16.59■□□□□ 0.25
HERC3-205ENST00000426683 GK5Q6ZS86 529 aa16.59■□□□□ 0.25
HERC3-205ENST00000426683 FBXW8Q8N3Y1 598 aa16.59■□□□□ 0.25
HERC3-205ENST00000426683 OR7A2PQ8NGA2 310 aa16.59■□□□□ 0.25
HERC3-205ENST00000426683 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
HERC3-205ENST00000426683 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
HERC3-205ENST00000426683 VSTM2LQ96N03 204 aa16.59■□□□□ 0.25
HERC3-205ENST00000426683 MEAF6Q9HAF1 191 aa16.59■□□□□ 0.25
HERC3-205ENST00000426683 FOLH1BQ9HBA9 442 aa16.59■□□□□ 0.25
HERC3-205ENST00000426683 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
HERC3-205ENST00000426683 ASIC5Q9NY37 505 aa16.59■□□□□ 0.25
HERC3-205ENST00000426683 CNIH4Q9P003 139 aa16.59■□□□□ 0.25
HERC3-205ENST00000426683 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
HERC3-205ENST00000426683 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
HERC3-205ENST00000426683 CLEC18AA5D8T8 446 aa16.58■□□□□ 0.24
HERC3-205ENST00000426683 UPK1AO00322 258 aa16.58■□□□□ 0.24
HERC3-205ENST00000426683 KLF11O14901 512 aa16.58■□□□□ 0.24
HERC3-205ENST00000426683 TO15178 435 aa16.58■□□□□ 0.24
HERC3-205ENST00000426683 ASNA1O43681 348 aa16.58■□□□□ 0.24
HERC3-205ENST00000426683 ERN1O75460 977 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
HERC3-205ENST00000426683 NAGAP17050 411 aa16.58■□□□□ 0.24
HERC3-205ENST00000426683 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
HERC3-205ENST00000426683 FRKP42685 505 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
HERC3-205ENST00000426683 MANFP55145 182 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
HERC3-205ENST00000426683 CORO7P57737 925 aa16.58■□□□□ 0.24
HERC3-205ENST00000426683 PPIAP62937 165 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
HERC3-205ENST00000426683 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
HERC3-205ENST00000426683 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
HERC3-205ENST00000426683 CLEC18BQ6UXF7 455 aa16.58■□□□□ 0.24
HERC3-205ENST00000426683 OR2L13Q8N349 312 aa16.58■□□□□ 0.24
HERC3-205ENST00000426683 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa16.58■□□□□ 0.24
HERC3-205ENST00000426683 CLEC18CQ8NCF0 446 aa16.58■□□□□ 0.24
HERC3-205ENST00000426683 SPPL2AQ8TCT8 520 aa16.58■□□□□ 0.24
HERC3-205ENST00000426683 DIO2Q92813 273 aa16.58■□□□□ 0.24
HERC3-205ENST00000426683 OMA1Q96E52 524 aa16.58■□□□□ 0.24
HERC3-205ENST00000426683 BTBD9Q96Q07 612 aa16.58■□□□□ 0.24
HERC3-205ENST00000426683 TTTY12Q9BZ98 90 aa16.58■□□□□ 0.24
HERC3-205ENST00000426683 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
HERC3-205ENST00000426683 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
HERC3-205ENST00000426683 RELNP78509 3460 aa16.57■□□□□ 0.24
HERC3-205ENST00000426683 FAM166BA8MTA8 275 aa16.57■□□□□ 0.24
HERC3-205ENST00000426683 SLCO1B7G3V0H7 640 aa16.57■□□□□ 0.24
HERC3-205ENST00000426683 ACOT7O00154 380 aa16.57■□□□□ 0.24
HERC3-205ENST00000426683 HDAC3O15379 428 aa16.57■□□□□ 0.24
HERC3-205ENST00000426683 SEMA7AO75326 666 aa16.57■□□□□ 0.24
HERC3-205ENST00000426683 PPM1BO75688 479 aa16.57■□□□□ 0.24
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