RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC44A1Q8WWI5 657 aa11.98□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OMA1Q96E52 524 aa11.98□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NODALQ96S42 347 aa11.98□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ERP44Q9BS26 406 aa11.98□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ITPAQ9BY32 194 aa11.98□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR2B2Q9GZK3 357 aa11.98□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GALNT9Q9HCQ5 603 aa11.98□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GRHL1Q9NZI5 618 aa11.98□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLRF1Q9NZS2 232 aa11.98□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAPRE3Q9UPY8 281 aa11.98□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CFL2Q9Y281 166 aa11.98□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FN1P02751 2386 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A087X1B8 175 aa11.97□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A1B0GTL3 188 aa11.97□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM187AA6NFU0 413 aa11.97□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ICOSLGO75144 302 aa11.97□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CLDN9O95484 217 aa11.97□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PORP16435 677 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 S1PR1P21453 382 aa11.97□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GNG11P61952 73 aa11.97□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SRYQ05066 204 aa11.97□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SNTA1Q13424 505 aa11.97□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NAB1Q13506 487 aa11.97□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 Q5PR19 223 aa11.97□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ENPP6Q6UWR7 440 aa11.97□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLXDC2Q6UX71 529 aa11.97□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TAOK1Q7L7X3 1001 aa11.97□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NUP54Q7Z3B4 507 aa11.97□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC91Q7Z6B0 441 aa11.97□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GCNT2Q8N0V5 402 aa11.97□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR14L1PQ8NHC6 308 aa11.97□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WNT2BQ93097 391 aa11.97□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARSGQ96EG1 525 aa11.97□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDK15Q96Q40 435 aa11.97□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UCN2Q96RP3 112 aa11.97□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BRINP2Q9C0B6 783 aa11.97□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACBD3Q9H3P7 528 aa11.97□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PIGMQ9H3S5 423 aa11.97□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SERHLQ9NQF3 203 aa11.97□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CLCF1Q9UBD9 225 aa11.97□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADAM29Q9UKF5 820 aa11.97□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MED12LQ86YW9 2145 aa11.97□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRAMEF25A6NGN4 478 aa11.96□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM171A2A8MVW0 826 aa11.96□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACOX3O15254 700 aa11.96□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UGT2B11O75310 529 aa11.96□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CBR3O75828 277 aa11.96□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C2P06681 752 aa11.96□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLK1P06870 262 aa11.96□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NUDT7P0C024 238 aa11.96□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CNTFP26441 200 aa11.96□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACAP2Q15057 778 aa11.96□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa11.96□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SCIMPQ6UWF3 145 aa11.96□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IFNEQ86WN2 208 aa11.96□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WDSUB1Q8N9V3 476 aa11.96□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR52B6Q8NGF0 335 aa11.96□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FBF1Q8TES7 1133 aa11.96□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COX4I2Q96KJ9 171 aa11.96□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 G6PC3Q9BUM1 346 aa11.96□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAT2BQ9NZL9 334 aa11.96□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EHD3Q9NZN3 535 aa11.96□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RNF14Q9UBS8 474 aa11.96□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BCAP29Q9UHQ4 241 aa11.96□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PACSIN3Q9UKS6 424 aa11.96□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TESMINQ9Y4I5 508 aa11.96□□□□□ -0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C1orf226A1L170 272 aa11.95□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GOLGA6L10A6NI86 522 aa11.95□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR7A17O14581 309 aa11.95□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CASKO14936 926 aa11.95□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARHGEF9O43307 516 aa11.95□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAD51CO43502 376 aa11.95□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATP1B1P05026 303 aa11.95□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHMP24386 653 aa11.95□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CPOXP36551 454 aa11.95□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LHX2P50458 406 aa11.95□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DIO3P55073 304 aa11.95□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GFRA1P56159 465 aa11.95□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MGAT2Q10469 447 aa11.95□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAP4K2Q12851 820 aa11.95□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GAB1Q13480 694 aa11.95□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa11.95□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FRG2Q64ET8 278 aa11.95□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC48A1Q6P1K1 146 aa11.95□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM111BQ6SJ93 734 aa11.95□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PAGE2Q7Z2X7 111 aa11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms