RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397893.3

SUMO3-202, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SUMO3, Length 520 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3-202ENST00000397893 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa6.51□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa6.51□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 TRIM64BA6NI03 449 aa6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 ARHGEF33A8MVX0 844 aa6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 CLDN25C9JDP6 229 aa6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 H0YGG7 62 aa6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 K7EPI3 171 aa6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 SLC28A1O00337 649 aa6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 KPNA5O15131 536 aa6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 RGS14O43566 566 aa6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 FOXS1O43638 330 aa6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 HS6ST1O60243 411 aa6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 NIPSNAP2O75323 286 aa6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 OTCP00480 354 aa6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 HPP00738 406 aa6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 CST1P01037 141 aa6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 ALPLP05186 524 aa6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 INHBBP09529 407 aa6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 TFPTP0C1Z6 253 aa6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 ZGLP1P0C6A0 271 aa6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 MATN1P21941 496 aa6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 VAMP1P23763 118 aa6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 CRHBPP24387 322 aa6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 ITGA3P26006 1051 aa6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 MFAP5Q13361 173 aa6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 TGFBIQ15582 683 aa6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 IMPG1Q17R60 797 aa6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 SMU1Q2TAY7 513 aa6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 ANKDD1AQ495B1 522 aa6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 VWA2Q5GFL6 755 aa6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 C6orf136Q5SQH8 315 aa6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 C6orf141Q5SZD1 244 aa6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 FAM219BQ5XKK7 198 aa6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 CYP20A1Q6UW02 462 aa6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 ADCK1Q86TW2 530 aa6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 PAQR7Q86WK9 346 aa6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 SPARTQ8N0X7 666 aa6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 SHISA5Q8N114 240 aa6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 PARP8Q8N3A8 854 aa6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 SVOPQ8N4V2 548 aa6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 SLC15A4Q8N697 577 aa6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 CDYL2Q8N8U2 506 aa6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 OR5K1Q8NHB7 308 aa6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 FBXO30Q8TB52 745 aa6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 METTL6Q8TCB7 284 aa6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 STT3BQ8TCJ2 826 aa6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 GRHL3Q8TE85 626 aa6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 FAR1Q8WVX9 515 aa6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 TM9SF4Q92544 642 aa6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 NCLNQ969V3 563 aa6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 MUL1Q969V5 352 aa6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 CCDC115Q96NT0 180 aa6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 OR2A5Q96R48 311 aa6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 ZNF347Q96SE7 839 aa6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 CCDC90BQ9GZT6 254 aa6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 LHPPQ9H008 270 aa6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 TOR3AQ9H497 397 aa6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 MAGIXQ9H6Y5 334 aa6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 GORASP2Q9H8Y8 452 aa6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 ACTR8Q9H981 624 aa6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 FAM118AQ9NWS6 357 aa6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 SELENONQ9NZV5 590 aa6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 SPATA7Q9P0W8 599 aa6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 ERGIC3Q9Y282 383 aa6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 MAU2Q9Y6X3 613 aa6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 PCM1Q15154 2024 aa6.5□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 PDZD2O15018 2839 aa6.49□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 PCNX1Q96RV3 2341 aa6.49□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 ZGRF1Q86YA3 2104 aa6.49□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa6.49□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 ELOVL7A1L3X0 281 aa6.49□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 FAM220BPB1ANY3 271 aa6.49□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 J3QRK9 145 aa6.49□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 CXCR6O00574 342 aa6.49□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 SLC22A1O15245 554 aa6.49□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 UGT2B11O75310 529 aa6.49□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 SULT1C4O75897 302 aa6.49□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 PRSS23O95084 383 aa6.49□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 ESR1P03372 595 aa6.49□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 STSP08842 583 aa6.49□□□□□ -1.37
SUMO3-202ENST00000397893 FBXO45P0C2W1 286 aa6.49□□□□□ -1.37
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