RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366197.9

ZNF548-202, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF548, Length 4,955 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-202ENST00000366197 ENAMQ9NRM1 1142 aa9.8□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 VNN3Q9NY84 501 aa9.8□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 SH2B3Q9UQQ2 575 aa9.8□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 NWD2Q9ULI1 1742 aa9.8□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 MYH6P13533 1939 aa9.8□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 LOC100509620A0A075B734 347 aa9.8□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 ADAP00813 363 aa9.8□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 CKMT1AP12532 417 aa9.8□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 MAGEA6P43360 314 aa9.8□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 HSD11B2P80365 405 aa9.8□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 SPHARQ15513 63 aa9.8□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 TRAM1Q15629 374 aa9.8□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 VTCN1Q7Z7D3 282 aa9.8□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 NLGN4XQ8N0W4 816 aa9.8□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 CNIH3Q8TBE1 160 aa9.8□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 SLC6A15Q9H2J7 730 aa9.8□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 I3L1I5 382 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 GSTT2P0CG29 244 aa9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 GPR4P46093 362 aa9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 RGRP47804 291 aa9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 ERVFC1P60507 584 aa9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 CTBSQ01459 385 aa9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 LIPKQ5VXJ0 399 aa9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 FAM180BQ6P0A1 224 aa9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 MFSD6LQ8IWD5 586 aa9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 OR52E1Q8NGJ3 308 aa9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 OR2L2Q8NH16 312 aa9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 KCNN1Q92952 543 aa9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 HLA-CQ95604 372 aa9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 GAL3ST3Q96A11 431 aa9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 SLC39A13Q96H72 371 aa9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 MS4A4EQ96PG1 132 aa9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 DUSP23Q9BVJ7 150 aa9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 GSTO2Q9H4Y5 243 aa9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 DLGAP1O14490 977 aa9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 RASAL1O95294 804 aa9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 CERS1P27544 350 aa9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 POU4F2Q12837 409 aa9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 RAB39AQ14964 217 aa9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 SLC14A2Q15849 920 aa9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 FAM78AQ5JUQ0 283 aa9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 FOXRED2Q8IWF2 684 aa9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 VWA5B2Q8N398 1253 aa9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 ACOT4Q8N9L9 421 aa9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 OR14L1PQ8NHC6 308 aa9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 THAP6Q8TBB0 222 aa9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 MAL2Q969L2 176 aa9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 CCDC115Q96NT0 180 aa9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 PITX2Q99697 317 aa9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 SYT11Q9BT88 431 aa9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 ABCD2Q9UBJ2 740 aa9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 ZNF43P17038 809 aa9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 ELK4P28324 431 aa9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 CD6P30203 668 aa9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 CCR7P32248 378 aa9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 RIDAP52758 137 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 KIAA0895LQ68EN5 471 aa9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 ZNF367Q7RTV3 350 aa9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 SAMD12Q8N8I0 201 aa9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 TANKQ92844 425 aa9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 MSLNLQ96KJ4 702 aa9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 RXFP3Q9NSD7 469 aa9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 DHDHQ9UQ10 334 aa9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 BAIAP2Q9UQB8 552 aa9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa9.78□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 SOBPA7XYQ1 873 aa9.78□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 DISC1C4P0D8 188 aa9.78□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 RDH16O75452 317 aa9.78□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 JRKO75564 520 aa9.78□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 RAD51DO75771 328 aa9.78□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 DNAJB5O75953 348 aa9.78□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 LCN8Q6JVE9 175 aa9.78□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 XKR5Q6UX68 686 aa9.78□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 CEACAM19Q7Z692 300 aa9.78□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 NAGSQ8N159 534 aa9.78□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 ZNF611Q8N823 705 aa9.78□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 CPNE7Q9UBL6 633 aa9.78□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 RGPD2P0DJD1 1756 aa9.78□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 BTAF1O14981 1849 aa9.78□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa9.78□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 J3QRK9 145 aa9.78□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 ATE1O95260 518 aa9.78□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 RPS17P08708 135 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 F3P13726 295 aa9.78□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 GGT1P19440 569 aa9.78□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 CAPN3P20807 821 aa9.78□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 CTXN1P60606 82 aa9.78□□□□□ -0.84
ZNF548-202ENST00000366197 E2F1Q01094 437 aa9.78□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms