RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 A0A087WWV3 80 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 A0A0J9YVX5 310 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 KRT87PA6NCN2 255 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 LRIT2A6NDA9 550 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF840PA6NDX5 716 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 E2F3O00716 465 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF253O75346 499 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 RHBDL1O75783 438 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 VENTXO95231 258 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 PIGRP01833 764 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 RALAP11233 206 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 IL10P22301 178 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRDX6P30041 224 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 AKT2P31751 481 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 HSPA1LP34931 641 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 SAA4P35542 130 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 HMGCLP35914 325 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 SGSHP51688 502 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 IST1P53990 364 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 HMGCS2P54868 508 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 VCPP55072 806 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP2.1□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 NOP14P78316 857 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF85Q03923 595 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 BNIP1Q12981 228 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 SNX1Q13596 522 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 RUNX3Q13761 415 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 PPP1R3AQ16821 1122 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 LINC00242Q5T6M2 205 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 TATDN1Q6P1N9 297 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 CNSTQ6PJW8 725 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 ATRAIDQ6UW56 229 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM159AQ6UWV7 190 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 P4HA3Q7Z4N8 544 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 ADCK1Q86TW2 530 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 AMZ2Q86W34 360 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF619Q8N2I2 560 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 CENPSQ8N2Z9 138 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP2.1□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 CRYGNQ8WXF5 182 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP2.1□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 APOL2Q9BQE5 337 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 NDUFAF3Q9BU61 184 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 TSPY26PQ9H489 355 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 ESM1Q9NQ30 184 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 TIGARQ9NQ88 270 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 STARD5Q9NSY2 213 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 RAI14Q9P0K7 980 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 SENP1Q9P0U3 644 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPASTQ9UBP0 616 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 IL20RAQ9UHF4 553 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 FZR1Q9UM11 496 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 FKBP7Q9Y680 259 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZMYM6O95789 1325 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 SYNJ2O15056 1496 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP2.09□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 MFSD2BA6NFX1 497 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 ADAM12O43184 909 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 SEC22BO75396 215 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 ECDO95905 644 aaPredicted RBP2.09□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 TGFAP01135 160 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 GHRP10912 638 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 ETS1P14921 441 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 CYP11B1P15538 503 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 GAP43P17677 238 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 RFC2P35250 354 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC26A5P58743 744 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 KRTAP10-12P60413 245 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 HAND2P61296 217 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 NAAAQ02083 359 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 SRYQ05066 204 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC10A1Q14973 349 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 CD226Q15762 336 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP2.09□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 Q1RN00 199 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 PARP6Q2NL67 630 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF699Q32M78 642 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP2.09□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 PARP10Q53GL7 1025 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 MS4A13Q5J8X5 152 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC25A30Q5SVS4 291 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 ERICH1Q86X53 443 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 MARCH9Q86YJ5 346 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 ELMOD2Q8IZ81 293 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR4F17Q8NGA8 305 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR8H1Q8NGG4 311 aa2.09□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms