RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000337004.8

PTDSS1-201, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTDSS1, Length 2,366 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-201ENST00000337004 PINK1Q9BXM7 581 aa20.25■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 CTPS2Q9NRF8 586 aa20.25■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 SNX7Q9UNH6 387 aa20.25■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 MAN2B1O00754 1011 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 AP3D1O14617 1153 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 TMCC2O75069 709 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 CLEC2LP0C7M8 214 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 EPCAMP16422 314 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 DDOSTP39656 456 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 RPS5P46782 204 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 DAB2P98082 770 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 TPBGQ13641 420 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 ZNF234Q14588 700 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 TAB1Q15750 504 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 GPR19Q15760 415 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 DUSP6Q16828 381 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 HMGN2P46Q86SG4 172 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 GATAD2AQ86YP4 633 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 LINC01555Q8NAE3 123 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 SLC9A6Q92581 669 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 UFD1Q92890 307 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 SLC38A2Q96QD8 506 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 FERD3LQ96RJ6 166 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 SAP130Q9H0E3 1048 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 MEIOCA2RUB1 952 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 FAM172BPA6NC97 362 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 WASHC1A8K0Z3 465 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 PPM1DO15297 605 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 SDC2P34741 201 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 GAS1P54826 345 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 ZFP69Q49AA0 526 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 FLYWCH1Q4VC44 716 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 GPAT3Q53EU6 434 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 OR2G6Q5TZ20 316 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 WASH2PQ6VEQ5 465 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 POF1BQ8WVV4 589 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 GATAD2BQ8WXI9 593 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 MIXL1Q9H2W2 232 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 EGLN3Q9H6Z9 239 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 GLOD5A6NK44 160 aa20.23■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 CENPXA8MT69 81 aa20.23■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 MTNR1AP48039 350 aa20.23■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 ZNF793Q6ZN11 406 aa20.23■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 KIF18BQ86Y91 864 aa20.23■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 SFXN5Q8TD22 340 aa20.23■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 NR4A3Q92570 626 aa20.23■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 HDAC8Q9BY41 377 aa20.23■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 PRRG3Q9BZD7 231 aa20.23■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 PCDH10Q9P2E7 1040 aa20.23■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 SLC13A4Q9UKG4 626 aa20.23■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 ACSL5Q9ULC5 683 aa20.23■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 INSL6Q9Y581 213 aa20.23■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 CCDC182A6NF36 153 aa20.23■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 HMX3A6NHT5 357 aa20.23■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 TRAPPC2P0DI81 140 aa20.23■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 TRAPPC2BP0DI82 140 aa20.23■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 MAN2A2P49641 1150 aa20.23■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 TAS2R41P59536 307 aa20.23■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 MINDY4Q4G0A6 757 aa20.23■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa20.23■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 A0A087WUU8 490 aa20.22■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 GUCY1B2O75343 617 aa20.22■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 VIPR2P41587 438 aa20.22■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 RPS25P62851 125 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 FUT5Q11128 374 aa20.22■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 HYAL2Q12891 473 aa20.22■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 SLAMF1Q13291 335 aa20.22■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa20.22■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa20.22■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 MRGPREQ86SM8 312 aa20.22■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 GJD3Q8N144 294 aa20.22■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 ANKK1Q8NFD2 765 aa20.22■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 OR56A1Q8NGH5 318 aa20.22■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 SUSD6Q92537 303 aa20.22■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 TM9SF4Q92544 642 aa20.22■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 MOAP1Q96BY2 351 aa20.22■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 ST6GAL2Q96JF0 529 aa20.22■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 MARCH7Q9H992 704 aa20.22■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 ANKRA2Q9H9E1 313 aa20.22■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 TFECO14948 347 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 APOL3O95236 402 aa20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms