RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa21.28■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 RNF215Q9Y6U7 377 aa21.28■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 LATS1O95835 1130 aa21.28■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 LRRTM3Q86VH5 581 aa21.28■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 SLC41A3Q96GZ6 507 aa21.28■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 NECTIN4Q96NY8 510 aa21.28■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 INPP5KQ9BT40 448 aa21.28■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 HDHD5Q9BXW7 423 aa21.28■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 GPRC5BQ9NZH0 403 aa21.28■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa21.28■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 CTSAP10619 480 aa21.28■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 IFNGR1P15260 489 aa21.28■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 CLDN2P57739 230 aa21.28■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 FOXJ1Q92949 421 aa21.28■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 ACOT7O00154 380 aa21.28■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 FAM189BP81408 668 aa21.28■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 DSC1Q08554 894 aa21.28■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 POU4F2Q12837 409 aa21.28■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 RSU1Q15404 277 aa21.28■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 UNC5DQ6UXZ4 953 aa21.28■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 PPP1R3DO95685 299 aa21.28■■□□□ 1
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PTPRM-201ENST00000332175 LSSP48449 732 aa21.28■■□□□ 1
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PTPRM-201ENST00000332175 RAB33AQ14088 237 aa21.28■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
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PTPRM-201ENST00000332175 LAMP1P11279 417 aa21.27■■□□□ 1
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PTPRM-201ENST00000332175 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa21.27■■□□□ 1
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PTPRM-201ENST00000332175 SLC16A8O95907 504 aa21.27■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 CYBAP13498 195 aa21.27■■□□□ 1
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PTPRM-201ENST00000332175 C1orf220Q5T0J3 134 aa21.27■■□□□ 1
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PTPRM-201ENST00000332175 RELL1Q8IUW5 271 aa21.27■■□□□ 1
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PTPRM-201ENST00000332175 TMEM135Q86UB9 458 aa21.26■□□□□ 0.99
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