RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325897.4

CLVS1-201, Transcript of clavesin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLVS1, Length 3,486 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-201ENST00000325897 MAGEA6P43360 314 aa4.71□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 SRP9P49458 86 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 NME5P56597 212 aa4.71□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 TNK2Q07912 1038 aa4.71□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 TUSC3Q13454 348 aa4.71□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 MEP1AQ16819 746 aa4.71□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 UPP1Q16831 310 aa4.71□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 DEFB115Q30KQ5 88 aa4.71□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 BCL7AQ4VC05 210 aa4.71□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 COLEC12Q5KU26 742 aa4.71□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa4.71□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 MTFR2Q6P444 385 aa4.71□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 PQLC3Q8N755 202 aa4.71□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 BVESQ8NE79 360 aa4.71□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 CPT1CQ8TCG5 803 aa4.71□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 C2CD4CQ8TF44 421 aa4.71□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 HHIPL1Q96JK4 782 aa4.71□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 LRR1Q96L50 414 aa4.71□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa4.71□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 ADAM33Q9BZ11 813 aa4.71□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 PRRG3Q9BZD7 231 aa4.71□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 COQ10BQ9H8M1 238 aa4.71□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 TCF7L1Q9HCS4 588 aa4.71□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 NAGKQ9UJ70 344 aa4.71□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa4.71□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF281Q9Y2X9 895 aa4.71□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 INSL6Q9Y581 213 aa4.71□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 MAB21L2Q9Y586 359 aa4.71□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 IRAK3Q9Y616 596 aa4.71□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 SOCS6O14544 535 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 SSX4O60224 188 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 KAT7O95251 611 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 MED26O95402 600 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 LATS1O95835 1130 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 LDLRP01130 860 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 RPL10P27635 214 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 SLC25A3Q00325 362 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 MAB21L1Q13394 359 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 LAPTM4AQ15012 233 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 BEX5Q5H9J7 111 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 FNBP1LQ5T0N5 605 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 SYPL2Q5VXT5 272 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 DMRTA1Q5VZB9 504 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 OVOS1Q6IE37 1185 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 BRICD5Q6PL45 260 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 PAQR9Q6ZVX9 377 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 NRARPQ7Z6K4 114 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 SLITRK4Q8IW52 837 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 STPG2Q8N412 459 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 MFSD9Q8NBP5 474 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 KLHDC9Q8NEP7 349 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 BPIFCQ8NFQ6 507 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 STK35Q8TDR2 534 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 EDEM1Q92611 657 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 HAS2Q92819 552 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 TSPAN17Q96FV3 270 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 SLC30A3Q99726 388 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 ACTL8Q9H568 366 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 EPHX3Q9H6B9 360 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 SLAMF7Q9NQ25 335 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 TRPC4Q9UBN4 977 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 YJEFN3A6XGL0 299 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 CHADO15335 359 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 SIGLEC5O15389 551 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 PIAS1O75925 651 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 SUPT7LO94864 414 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 AKR7A3O95154 331 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 FGBP02675 491 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 INHBAP08476 426 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 MYOGP15173 224 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 ACPPP15309 386 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 TYMPP19971 482 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 CST5P28325 142 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 LIPAP38571 399 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 ETV6P41212 452 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 GUCA2BQ16661 112 aa4.7□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms