RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299335.7

COX11-201, Transcript of cytochrome c oxidase copper chaperone COX11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COX11, Length 2,497 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX11-201ENST00000299335 QSOX2Q6ZRP7 698 aa14.65□□□□□ -0.06
COX11-201ENST00000299335 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa14.65□□□□□ -0.06
COX11-201ENST00000299335 NOXA1Q86UR1 476 aa14.65□□□□□ -0.06
COX11-201ENST00000299335 TMEM163Q8TC26 289 aa14.65□□□□□ -0.06
COX11-201ENST00000299335 UBASH3BQ8TF42 649 aa14.65□□□□□ -0.06
COX11-201ENST00000299335 RGMAQ96B86 450 aa14.65□□□□□ -0.06
COX11-201ENST00000299335 HHIPL1Q96JK4 782 aa14.65□□□□□ -0.06
COX11-201ENST00000299335 ANKRA2Q9H9E1 313 aa14.65□□□□□ -0.06
COX11-201ENST00000299335 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
COX11-201ENST00000299335 A0A087WUU8 490 aa14.65□□□□□ -0.06
COX11-201ENST00000299335 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa14.65□□□□□ -0.06
COX11-201ENST00000299335 GLOD5A6NK44 160 aa14.65□□□□□ -0.06
COX11-201ENST00000299335 NTN1O95631 604 aa14.65□□□□□ -0.06
COX11-201ENST00000299335 PRNPP04156 253 aa14.65□□□□□ -0.06
COX11-201ENST00000299335 LIMS3P0CW19 117 aa14.65□□□□□ -0.06
COX11-201ENST00000299335 LIMS4P0CW20 117 aa14.65□□□□□ -0.06
COX11-201ENST00000299335 PPP2R1BP30154 601 aa14.65□□□□□ -0.06
COX11-201ENST00000299335 MTNR1AP48039 350 aa14.65□□□□□ -0.06
COX11-201ENST00000299335 EPHA5P54756 1037 aa14.65□□□□□ -0.06
COX11-201ENST00000299335 CD83Q01151 205 aa14.65□□□□□ -0.06
COX11-201ENST00000299335 DMPKQ09013 629 aa14.65□□□□□ -0.06
COX11-201ENST00000299335 DHCR24Q15392 516 aa14.65□□□□□ -0.06
COX11-201ENST00000299335 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa14.65□□□□□ -0.06
COX11-201ENST00000299335 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
COX11-201ENST00000299335 ZNF765Q7L2R6 523 aa14.65□□□□□ -0.06
COX11-201ENST00000299335 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa14.65□□□□□ -0.06
COX11-201ENST00000299335 AMZ2Q86W34 360 aa14.65□□□□□ -0.06
COX11-201ENST00000299335 OR8D4Q8NGM9 314 aa14.65□□□□□ -0.06
COX11-201ENST00000299335 PRRC1Q96M27 445 aa14.65□□□□□ -0.06
COX11-201ENST00000299335 DPH7Q9BTV6 452 aa14.65□□□□□ -0.06
COX11-201ENST00000299335 MENTQ9BUN1 341 aa14.65□□□□□ -0.06
COX11-201ENST00000299335 TAS2R7Q9NYW3 318 aa14.65□□□□□ -0.06
COX11-201ENST00000299335 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
COX11-201ENST00000299335 LRRK1Q38SD2 2015 aa14.64□□□□□ -0.07
COX11-201ENST00000299335 A0A1W2PPV9 198 aa14.64□□□□□ -0.07
COX11-201ENST00000299335 HIDE1A8MVS5 230 aa14.64□□□□□ -0.07
COX11-201ENST00000299335 VEGFDO43915 354 aa14.64□□□□□ -0.07
COX11-201ENST00000299335 LALBAP00709 142 aa14.64□□□□□ -0.07
COX11-201ENST00000299335 SERPIND1P05546 499 aa14.64□□□□□ -0.07
COX11-201ENST00000299335 ALPPL2P10696 532 aa14.64□□□□□ -0.07
COX11-201ENST00000299335 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
COX11-201ENST00000299335 SOX18P35713 384 aa14.64□□□□□ -0.07
COX11-201ENST00000299335 SLC6A11P48066 632 aa14.64□□□□□ -0.07
COX11-201ENST00000299335 REEP5Q00765 189 aa14.64□□□□□ -0.07
COX11-201ENST00000299335 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
COX11-201ENST00000299335 MLC1Q15049 377 aa14.64□□□□□ -0.07
COX11-201ENST00000299335 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa14.64□□□□□ -0.07
COX11-201ENST00000299335 TCEAL5Q5H9L2 206 aa14.64□□□□□ -0.07
COX11-201ENST00000299335 PPP2R2DQ66LE6 453 aa14.64□□□□□ -0.07
COX11-201ENST00000299335 ZNF438Q7Z4V0 828 aa14.64□□□□□ -0.07
COX11-201ENST00000299335 LHFPL3Q86UP9 236 aa14.64□□□□□ -0.07
COX11-201ENST00000299335 LINC00471Q8N535 108 aa14.64□□□□□ -0.07
COX11-201ENST00000299335 SIMC1Q8NDZ2 872 aa14.64□□□□□ -0.07
COX11-201ENST00000299335 ANKK1Q8NFD2 765 aa14.64□□□□□ -0.07
COX11-201ENST00000299335 OR5K2Q8NHB8 316 aa14.64□□□□□ -0.07
COX11-201ENST00000299335 UFD1Q92890 307 aa14.64□□□□□ -0.07
COX11-201ENST00000299335 NXPE3Q969Y0 559 aa14.64□□□□□ -0.07
COX11-201ENST00000299335 LRRC3BQ96PB8 259 aa14.64□□□□□ -0.07
COX11-201ENST00000299335 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
COX11-201ENST00000299335 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa14.64□□□□□ -0.07
COX11-201ENST00000299335 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
COX11-201ENST00000299335 RMI1Q9H9A7 625 aa14.64□□□□□ -0.07
COX11-201ENST00000299335 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
COX11-201ENST00000299335 PRRT4C9JH25 899 aa14.64□□□□□ -0.07
COX11-201ENST00000299335 ADRB3P13945 408 aa14.64□□□□□ -0.07
COX11-201ENST00000299335 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.072e-15■■□□□ 14.3
COX11-201ENST00000299335 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa14.64□□□□□ -0.07
COX11-201ENST00000299335 OR4C11Q6IEV9 310 aa14.64□□□□□ -0.07
COX11-201ENST00000299335 SLC27A4Q6P1M0 643 aa14.64□□□□□ -0.07
COX11-201ENST00000299335 SLC36A4Q6YBV0 504 aa14.64□□□□□ -0.07
COX11-201ENST00000299335 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa14.64□□□□□ -0.07
COX11-201ENST00000299335 GLCCI1Q86VQ1 547 aa14.64□□□□□ -0.07
COX11-201ENST00000299335 AP3S1Q92572 193 aa14.64□□□□□ -0.07
COX11-201ENST00000299335 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
COX11-201ENST00000299335 C17orf62Q9BQA9 187 aa14.64□□□□□ -0.07
COX11-201ENST00000299335 AICDAQ9GZX7 198 aa14.64□□□□□ -0.07
COX11-201ENST00000299335 BCL2L10Q9HD36 194 aa14.64□□□□□ -0.07
COX11-201ENST00000299335 KCNE3Q9Y6H6 103 aa14.64□□□□□ -0.07
COX11-201ENST00000299335 COL4A3Q01955 1670 aa14.63□□□□□ -0.07
COX11-201ENST00000299335 FGBP02675 491 aa14.63□□□□□ -0.07
COX11-201ENST00000299335 STATHP02808 62 aa14.63□□□□□ -0.07
COX11-201ENST00000299335 YES1P07947 543 aa14.63□□□□□ -0.07
COX11-201ENST00000299335 GSTM3P21266 225 aa14.63□□□□□ -0.07
COX11-201ENST00000299335 GABRA5P31644 462 aa14.63□□□□□ -0.07
COX11-201ENST00000299335 VASPP50552 380 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
COX11-201ENST00000299335 ERVFC1P60507 584 aa14.63□□□□□ -0.07
COX11-201ENST00000299335 UBE3AQ05086 875 aa14.63□□□□□ -0.07
COX11-201ENST00000299335 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
COX11-201ENST00000299335 P2RY14Q15391 338 aa14.63□□□□□ -0.07
COX11-201ENST00000299335 ZNF750Q32MQ0 723 aa14.63□□□□□ -0.07
COX11-201ENST00000299335 C9orf64Q5T6V5 341 aa14.63□□□□□ -0.07
COX11-201ENST00000299335 PAMR1Q6UXH9 720 aa14.63□□□□□ -0.07
COX11-201ENST00000299335 ZNF793Q6ZN11 406 aa14.63□□□□□ -0.07
COX11-201ENST00000299335 ZNF485Q8NCK3 441 aa14.63□□□□□ -0.07
COX11-201ENST00000299335 TEX47Q8TBZ9 253 aa14.63□□□□□ -0.07
COX11-201ENST00000299335 ENKURQ8TC29 256 aa14.63□□□□□ -0.07
COX11-201ENST00000299335 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
COX11-201ENST00000299335 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa14.63□□□□□ -0.07
COX11-201ENST00000299335 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa14.63□□□□□ -0.07
COX11-201ENST00000299335 CNIH4Q9P003 139 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms