RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM184CQ9NVA4 438 aa19.17■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 C1orf109Q9NX04 203 aa19.17■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 MAT2BQ9NZL9 334 aa19.17■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 MYF5P13349 255 aa19.17■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 KRT20P35900 424 aa19.17■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 NUBP1P53384 320 aa19.17■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 CYP4Z1Q86W10 505 aa19.17■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 LOXL4Q96JB6 756 aa19.17■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 ROGDIQ9GZN7 287 aa19.17■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 C12orf4Q9NQ89 552 aa19.17■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 EVA1BQ9NVM1 165 aa19.17■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 GMEB2Q9UKD1 530 aa19.17■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa19.17■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 NPIPB8E9PQR5 432 aa19.16■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 CXCR6O00574 342 aa19.16■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 SH3BGRLO75368 114 aa19.16■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 HSD3B1P14060 373 aa19.16■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 PRPH2P23942 346 aa19.16■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 HSD3B2P26439 372 aa19.16■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 LSSP48449 732 aa19.16■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 CD83Q01151 205 aa19.16■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 GTDC1Q4AE62 458 aa19.16■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa19.16■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 UBE2FQ969M7 185 aa19.16■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 NCLNQ969V3 563 aa19.16■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 APIPQ96GX9 242 aa19.16■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 CEP19Q96LK0 163 aa19.16■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 B3GNT4Q9C0J1 378 aa19.16■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 NT5DC2Q9H857 520 aa19.16■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 PRM3Q9NNZ6 103 aa19.16■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa19.16■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 LRIT1Q9P2V4 623 aa19.16■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 ELOVL7A1L3X0 281 aa19.16■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 YKT6O15498 198 aa19.16■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 OR1F1O43749 312 aa19.16■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 SEC22BO75396 215 aa19.16■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 CYP7B1O75881 506 aa19.16■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 CER1O95813 267 aa19.16■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 GRK5P34947 590 aa19.16■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 PIK3CBP42338 1070 aa19.16■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 CYP4F2P78329 520 aa19.16■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 MAPKAPK3Q16644 382 aa19.16■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 ARMC4Q5T2S8 1044 aa19.16■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 TCEAL6Q6IPX3 200 aa19.16■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 HIPK1Q86Z02 1210 aa19.16■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 MSRB3Q8IXL7 192 aa19.16■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 TCEAL3Q969E4 200 aa19.16■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 GON7Q9BXV9 100 aa19.16■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 RHBGQ9H310 441 aa19.16■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 C12orf10Q9HB07 376 aa19.16■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 VPS29Q9UBQ0 182 aa19.16■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 TRBC2A0A5B9 178 aa19.15■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 RHPN2P1A8MT19 583 aa19.15■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 M0R082 166 aa19.15■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 TSPAN9O75954 239 aa19.15■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 ITGA2P17301 1181 aa19.15■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 BCL6P41182 706 aa19.15■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 CAPZBP47756 277 aa19.15■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 SLC5A12Q1EHB4 618 aa19.15■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 SPANXN4Q5MJ08 99 aa19.15■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 PAQR7Q86WK9 346 aa19.15■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 KBTBD8Q8NFY9 601 aa19.15■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 TMCO6Q96DC7 493 aa19.15■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 CMTM7Q96FZ5 175 aa19.15■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 APOL4Q9BPW4 351 aa19.15■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 SNX7Q9UNH6 387 aa19.15■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 CTDSP2O14595 271 aa19.15■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 SYPP08247 313 aa19.15■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 AMD1P17707 334 aa19.15■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 CBLP22681 906 aa19.15■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 TIGD6Q17RP2 521 aa19.15■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 GPAT3Q53EU6 434 aa19.15■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa19.15■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 OR4C6Q8NH72 309 aa19.15■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 ZBTB18Q99592 522 aa19.15■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 MMP28Q9H239 520 aa19.15■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 SYNPO2LQ9H987 977 aa19.15■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 POMT2Q9UKY4 750 aa19.15■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa19.15■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 TGFB1P01137 390 aa19.14■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 PROS1P07225 676 aa19.14■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 PVRP15151 417 aa19.14■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 ARMC6Q6NXE6 501 aa19.14■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 SLC7A6Q92536 515 aa19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.7 ms