RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229270.8

TPI1-201, Transcript of triosephosphate isomerase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TPI1, Length 1,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPI1-201ENST00000229270 RPS26P62854 115 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 EFNB1P98172 346 aa24.74■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 NDUFA5Q16718 116 aa24.74■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 TMEM35AQ53FP2 167 aa24.74■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 DEF8Q6ZN54 512 aa24.74■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 RAB42Q8N4Z0 105 aa24.74■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 FAM181AQ8N9Y4 354 aa24.74■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 KLK6Q92876 244 aa24.74■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 RMI1Q9H9A7 625 aa24.74■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa24.74■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 OR1A2Q9Y585 309 aa24.74■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 SNX11Q9Y5W9 270 aa24.74■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 FAM227AF5H4B4 570 aa24.73■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 TPST2O60704 377 aa24.73■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 KHKP50053 298 aa24.73■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP24.73■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 KLHL22Q53GT1 634 aa24.73■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 C3orf38Q5JPI3 329 aa24.73■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 C1orf94Q6P1W5 598 aa24.73■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 USP30Q70CQ3 517 aa24.73■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 SLC44A3Q8N4M1 653 aa24.73■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 CLDN22Q8N7P3 220 aa24.73■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 OR4D11Q8NGI4 311 aa24.73■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 SLC7A13Q8TCU3 470 aa24.73■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 SLC6A18Q96N87 628 aa24.73■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 FAIM2Q9BWQ8 316 aa24.73■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 PLAGL1Q9UM63 463 aa24.73■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 A0A0A6YYD5 115 aa24.72■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 MYL12BO14950 172 aa24.72■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 CASC3O15234 703 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 TMPRSS11DO60235 418 aa24.72■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 NME6O75414 186 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 RAB36O95755 333 aa24.72■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 IGFALSP35858 605 aa24.72■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 RPS19P39019 145 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 CDK5Q00535 292 aa24.72■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 BNC1Q01954 994 aa24.72■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 RUNX1T1Q06455 604 aa24.72■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 HSPB3Q12988 150 aa24.72■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 ZNF544Q6NX49 715 aa24.72■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 BHLHB9Q6PI77 547 aa24.72■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 TCEANCQ8N8B7 351 aa24.72■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 FGF11Q92914 225 aa24.72■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 RAB8BQ92930 207 aa24.72■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 MOAP1Q96BY2 351 aa24.72■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 MED18Q9BUE0 208 aa24.72■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 SERHL2Q9H4I8 314 aa24.72■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 TM7SF3Q9NS93 570 aa24.72■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 ACSL5Q9ULC5 683 aa24.72■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 KLHL20Q9Y2M5 609 aa24.72■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 A0A1W2PPV9 198 aa24.72■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 SNTNA6NMZ2 147 aa24.72■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 RTCAO00442 366 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 STK25O00506 426 aa24.72■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 CPEP16870 476 aa24.72■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 OR4C11Q6IEV9 310 aa24.72■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 TMEM53Q6P2H8 277 aa24.72■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa24.72■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 UBE3DQ7Z6J8 389 aa24.72■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 MRGPREQ86SM8 312 aa24.72■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 PRRC1Q96M27 445 aa24.72■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 KCNS3Q9BQ31 491 aa24.72■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 TIMM29Q9BSF4 260 aa24.72■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 FNDC11Q9BVV2 318 aa24.72■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 CLEC2DQ9UHP7 191 aa24.72■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa24.72■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 KCNJ13O60928 360 aa24.71■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 HBQ1P09105 142 aa24.71■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 DOC2BQ14184 412 aa24.71■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 PODNL1Q6PEZ8 512 aa24.71■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 PHC2Q8IXK0 858 aa24.71■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 GJD3Q8N144 294 aa24.71■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 SIPA1Q96FS4 1042 aa24.71■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 CAMK1GQ96NX5 476 aa24.71■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 OR2A14Q96R47 310 aa24.71■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 ACAT2Q9BWD1 397 aa24.71■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 OR51I1Q9H343 314 aa24.71■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 SOX14O95416 240 aa24.7■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 TRAPPC2P0DI81 140 aa24.7■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 TRAPPC2BP0DI82 140 aa24.7■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 NR2F1P10589 423 aa24.7■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 GIPRP48546 466 aa24.7■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 PSPHP78330 225 aa24.7■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 ASB15Q8WXK1 588 aa24.7■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 AMDHD1Q96NU7 426 aa24.7■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 BARHL1Q9BZE3 327 aa24.7■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 ABCG4Q9H172 646 aa24.7■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 V9GYH0 126 aa24.7■■□□□ 1.55
TPI1-201ENST00000229270 A0A0G2JPF8 293 aa24.7■■□□□ 1.54
TPI1-201ENST00000229270 PRR19A6NJB7 356 aa24.7■■□□□ 1.54
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