RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215941.8

ANKRD54-201, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD54, Length 2,184 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-201ENST00000215941 HSPB11Q9Y547 144 aa21.57■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 B8ZZF3 427 aa21.56■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa21.56■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 SAP18O00422 153 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 BNIP3LO60238 219 aa21.56■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 HPGDSO60760 199 aa21.56■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 MMP11P24347 488 aa21.56■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 MTNR1AP48039 350 aa21.56■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 ZER1Q7Z7L7 766 aa21.56■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 TBC1D19Q8N5T2 526 aa21.56■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa21.56■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 SYT14Q8NB59 555 aa21.56■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 OR4M1Q8NGD0 313 aa21.56■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 OR4K5Q8NGD3 323 aa21.56■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 GATAD2BQ8WXI9 593 aa21.56■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 ARMC5Q96C12 935 aa21.56■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa21.56■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 ASB6Q9NWX5 421 aa21.56■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 FBXW2Q9UKT8 454 aa21.56■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 GPSM3Q9Y4H4 160 aa21.56■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 FRKP42685 505 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 MANFP55145 182 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 OR2G6Q5TZ20 316 aa21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 ACSM5Q6NUN0 579 aa21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 C6orf120Q7Z4R8 191 aa21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 SLC9B2Q86UD5 537 aa21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 NR4A3Q92570 626 aa21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 OTULINQ96BN8 352 aa21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 TM9SF2Q99805 663 aa21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 PIGUQ9H490 435 aa21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 FAM8A1Q9UBU6 413 aa21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 HMGN4O00479 90 aa21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 PDPK1O15530 556 aa21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 CTSCP53634 463 aa21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 ATP12AP54707 1039 aa21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 Q6ZVL8 140 aa21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 OR4D11Q8NGI4 311 aa21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 GLYATL1Q969I3 302 aa21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 SLC38A2Q96QD8 506 aa21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 MVB12BQ9H7P6 319 aa21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 P2RX2Q9UBL9 471 aa21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 TEKT2Q9UIF3 430 aa21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 NINQ8N4C6 2090 aa21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa21.54■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 ANHXE9PGG2 379 aa21.54■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 FGBP02675 491 aa21.54■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 LIMS3P0CW19 117 aa21.54■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 LIMS4P0CW20 117 aa21.54■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 ERVFC1P60507 584 aa21.54■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 P2RY14Q15391 338 aa21.54■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 SLC27A4Q6P1M0 643 aa21.54■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 CMTM8Q8IZV2 173 aa21.54■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 SPERTQ8NA61 448 aa21.54■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 OR9A1PQ8NGU1 263 aa21.54■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 FOXJ1Q92949 421 aa21.54■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 RFKQ969G6 155 aa21.54■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 INSL6Q9Y581 213 aa21.54■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa21.54■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 AKR7A2O43488 359 aa21.54■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 RFPL3O75679 317 aa21.54■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 EPHX1P07099 455 aa21.54■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 IFNGR2P38484 337 aa21.54■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 CCR2P41597 374 aa21.54■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 ZBTB37Q5TC79 503 aa21.54■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 C9orf62Q8N4C0 152 aa21.54■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 POGLUT1Q8NBL1 392 aa21.54■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 MORN4Q8NDC4 146 aa21.54■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 TEX47Q8TBZ9 253 aa21.54■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 SMPDL3AQ92484 453 aa21.54■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 PRRC1Q96M27 445 aa21.54■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 KCNN3Q9UGI6 736 aa21.54■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 LINC00862A6NCI5 91 aa21.53■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 LRRC73Q5JTD7 316 aa21.53■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 IER5LQ5T953 404 aa21.53■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 HACD4Q5VWC8 232 aa21.53■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 KRT78Q8N1N4 520 aa21.53■■□□□ 1.04
ANKRD54-201ENST00000215941 SLC37A3Q8NCC5 494 aa21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms