RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635970.1

CLN8-209, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

TSL 5

Gene CLN8, Length 1,958 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-209ENST00000635970 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 POT1Q9NUX5 634 aa14.64□□□□□ -0.07
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CLN8-209ENST00000635970 ENOPH1Q9UHY7 261 aa14.64□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
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CLN8-209ENST00000635970 ALDH9A1P49189 494 aa14.63□□□□□ -0.07
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CLN8-209ENST00000635970 IQCCQ4KMZ1 466 aa14.63□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 ZNF367Q7RTV3 350 aa14.63□□□□□ -0.07
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CLN8-209ENST00000635970 TSSK3Q96PN8 268 aa14.63□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 ABCG4Q9H172 646 aa14.63□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 C3orf14Q9HBI5 128 aa14.63□□□□□ -0.07
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CLN8-209ENST00000635970 ZNF221Q9UK13 617 aa14.63□□□□□ -0.07
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CLN8-209ENST00000635970 HES3Q5TGS1 186 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 GDPD3Q7L5L3 318 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 ZNF605Q86T29 641 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 CCDC190Q86UF4 302 aa14.62□□□□□ -0.07
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CLN8-209ENST00000635970 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
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CLN8-209ENST00000635970 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
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CLN8-209ENST00000635970 TRAPPC2BP0DI82 140 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 CSF2RBP32927 897 aa14.62□□□□□ -0.07
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CLN8-209ENST00000635970 NOXRED1Q6NXP6 359 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 C19orf48Q6RUI8 117 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 VTCN1Q7Z7D3 282 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 SYTL1Q8IYJ3 562 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 STX19Q8N4C7 294 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 LILRB4Q8NHJ6 448 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 NUDT22Q9BRQ3 303 aa14.62□□□□□ -0.07
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CLN8-209ENST00000635970 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
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