RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 MTTPP55157 894 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 BTBD16Q32M84 506 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 VN1R5Q7Z5H4 357 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 ANKRD37Q7Z713 158 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 RIMKLAQ8IXN7 391 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 FBXW8Q8N3Y1 598 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF740Q8NDX6 193 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 C14orf79Q96F83 325 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 ITPR3Q14573 2671 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 H0YIG0 161 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 ADAM10O14672 748 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 NSA2O95478 260 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 ETHE1O95571 254 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 SMSP52788 366 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 CASP6P55212 293 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 NME5P56597 212 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 PSME3P61289 254 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 SPNS3Q6ZMD2 512 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 FGD2Q7Z6J4 655 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 RETREG3Q86VR2 466 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF354BQ96LW1 612 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 MACROD1Q9BQ69 325 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 KLHL1Q9NR64 748 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 ANKRD10Q9NXR5 420 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 TXNDC9O14530 226 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 GSTM5P46439 218 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 PTGR1Q14914 329 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 OR1C1Q15619 314 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM35AQ53FP2 167 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 KRTCAP3Q53RY4 240 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 SPINK14Q6IE38 97 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 ANKRD53Q8N9V6 530 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 TRPV3Q8NET8 790 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 METTL21AQ8WXB1 218 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 THAP11Q96EK4 314 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 MAGED4Q96JG8 741 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 QRFPRQ96P65 431 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 SPOCK3Q9BQ16 436 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 MS4A8Q9BY19 250 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 ENKD1Q9H0I2 346 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC7A8Q9UHI5 535 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 ADAM29Q9UKF5 820 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 SCN3AQ9NY46 2000 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 NPIPA5E9PKD4 350 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM227AF5H4B4 570 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 NEURL1O76050 574 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 RAE1P78406 368 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 RNFT1Q5M7Z0 435 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 C6orf163Q5TEZ5 329 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 PDSS2Q86YH6 399 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 OR51Q1Q8NH59 317 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP22.44■■□□□ 1.188e-53■■■□□ 14.8
CAPNS1-216ENST00000628306 DMRTA2Q96SC8 542 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 CDRT15Q96T59 188 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 MMP25Q9NPA2 562 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 HCN3Q9P1Z3 774 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 MCM8Q9UJA3 840 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 NPIPA1Q9UND3 350 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 SPG11Q96JI7 2443 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 CIB2O75838 187 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 TGFB1P01137 390 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 XCR1P46094 333 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 AVPR1BP47901 424 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 NDUFA9Q16795 377 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 PIGGQ5H8A4 983 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 ADNP2Q6IQ32 1131 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 CAMKMTQ7Z624 323 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 RNF175Q8N4F7 328 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 M1APQ8TC57 530 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 CREB3L4Q8TEY5 395 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 TM4SF19Q96DZ7 209 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 CENPKQ9BS16 269 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 SPAG4Q9NPE6 437 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM181Q9P2C4 612 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 OR1F1O43749 312 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 PGRP06401 933 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 IL1RNP18510 177 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 TACR1P25103 407 aa22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.7 ms