RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	6.85	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	6.85	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		6.85	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	COLEC10	Q9Y6Z7	277 aa		6.85	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	PIPSL	A2A3N6	862 aa		6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	LRRC14B	A6NHZ5	514 aa		6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495		H7C0S8	307 aa		6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	ABCD4	O14678	606 aa		6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	RFPL1	O75677	317 aa		6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	MT-CO3	P00414	261 aa		6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	CAT	P04040	527 aa	Known RBP	6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	TFEB	P19484	476 aa		6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	CSF2RB	P32927	897 aa		6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	ETV6	P41212	452 aa		6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	INSM1	Q01101	510 aa	Predicted RBP	6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	LRRC74A	Q0VAA2	488 aa		6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	NR6A1	Q15406	480 aa		6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	SGCA	Q16586	387 aa		6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	HES5	Q5TA89	166 aa		6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF425	Q6IV72	752 aa		6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	TIGD4	Q8IY51	512 aa		6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	RNF148	Q8N7C7	305 aa		6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	ASB12	Q8WXK4	309 aa		6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	NAT6	Q93015	286 aa		6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	UBXN10	Q96LJ8	280 aa		6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	KLHL15	Q96M94	604 aa		6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	BCL2L14	Q9BZR8	327 aa		6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	LRRN3	Q9H3W5	708 aa		6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	ADA2	Q9NZK5	511 aa		6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	RALY	Q9UKM9	306 aa	Known RBP	6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	FKBP7	Q9Y680	259 aa		6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	COL6A6	A6NMZ7	2263 aa		6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	METTL15	A6NJ78	407 aa		6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	ARHGEF33	A8MVX0	844 aa		6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	C1QTNF9B	B2RNN3	333 aa		6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	STX16-NPEPL1	H3BU86	382 aa		6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495		H7BY64	318 aa		6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	LYPLA1	O75608	230 aa	Predicted RBP	6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	TNFSF15	O95150	251 aa		6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	C2	P06681	752 aa		6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	C1QTNF9	P0C862	333 aa		6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	AOAH	P28039	575 aa		6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	HLA-DMA	P28067	261 aa		6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	GGT5	P36269	586 aa		6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	MAGEA6	P43360	314 aa		6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	CAPZA2	P47755	286 aa		6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	GABRE	P78334	506 aa		6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	EEF1A2	Q05639	463 aa	Known RBP	6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	TRAF3	Q13114	568 aa		6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	CBLB	Q13191	982 aa		6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	GPR19	Q15760	415 aa		6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC14A2	Q15849	920 aa		6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	PFKFB4	Q16877	469 aa		6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM207	Q6UWW9	146 aa		6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	OOSP2	Q86WS3	158 aa		6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	YIPF6	Q96EC8	236 aa		6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	MARK4	Q96L34	752 aa		6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	PPP1R36	Q96LQ0	422 aa		6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	CCDC74B	Q96LY2	380 aa		6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	PRAP1	Q96NZ9	151 aa		6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	PNPO	Q9NVS9	261 aa		6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM181	Q9P2C4	612 aa		6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	OPTC	Q9UBM4	332 aa		6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	IKZF3	Q9UKT9	509 aa		6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	VPS9D1	Q9Y2B5	631 aa		6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	RPH3A	Q9Y2J0	694 aa	Predicted RBP	6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		6.84	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	IGHV5-51	A0A0C4DH38	117 aa		6.83	□□□□□ -1.32
LETMD1-238	ENST00000623495	FEZF1	A0PJY2	475 aa		6.83	□□□□□ -1.32
LETMD1-238	ENST00000623495	AQP12B	A6NM10	295 aa		6.83	□□□□□ -1.32
LETMD1-238	ENST00000623495	DBX1	A6NMT0	343 aa		6.83	□□□□□ -1.32
LETMD1-238	ENST00000623495	EFCAB7	A8K855	629 aa		6.83	□□□□□ -1.32
LETMD1-238	ENST00000623495	UBXN8	O00124	270 aa		6.83	□□□□□ -1.32
LETMD1-238	ENST00000623495	SIX3	O95343	332 aa	Predicted RBP	6.83	□□□□□ -1.32
LETMD1-238	ENST00000623495	CLIC3	O95833	236 aa		6.83	□□□□□ -1.32
LETMD1-238	ENST00000623495	TSPAN12	O95859	305 aa		6.83	□□□□□ -1.32
LETMD1-238	ENST00000623495	FABP1	P07148	127 aa		6.83	□□□□□ -1.32
LETMD1-238	ENST00000623495	CTSB	P07858	339 aa		6.83	□□□□□ -1.32
LETMD1-238	ENST00000623495	ADORA3	P0DMS8	318 aa		6.83	□□□□□ -1.32
LETMD1-238	ENST00000623495	CKMT1A	P12532	417 aa		6.83	□□□□□ -1.32
LETMD1-238	ENST00000623495	OGN	P20774	298 aa	Known RBP	6.83	□□□□□ -1.32

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