RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620394.1

SRRT-218, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-218ENST00000620394 LIME1Q9H400 295 aa20.21■□□□□ 0.83
SRRT-218ENST00000620394 RASSF1Q9NS23 344 aa20.21■□□□□ 0.83
SRRT-218ENST00000620394 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
SRRT-218ENST00000620394 B4GALT7Q9UBV7 327 aa20.21■□□□□ 0.83
SRRT-218ENST00000620394 Q9UFV3 132 aa20.21■□□□□ 0.83
SRRT-218ENST00000620394 TRPS1Q9UHF7 1281 aa20.21■□□□□ 0.83
SRRT-218ENST00000620394 ACAD8Q9UKU7 415 aa20.21■□□□□ 0.83
SRRT-218ENST00000620394 SLC12A4Q9UP95 1085 aa20.21■□□□□ 0.83
SRRT-218ENST00000620394 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa20.21■□□□□ 0.83
SRRT-218ENST00000620394 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa20.2■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 C1orf226A1L170 272 aa20.2■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa20.2■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 PPP6CO00743 305 aa20.2■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 TP53I11O14683 189 aa20.2■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 GUCY1B2O75343 617 aa20.2■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 PDYNP01213 254 aa20.2■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 ATP1B1P05026 303 aa20.2■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 GABRA1P14867 456 aa20.2■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 S1PR1P21453 382 aa20.2■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 GCAP28676 217 aa20.2■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 XKP51811 444 aa20.2■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 C1orf185Q5T7R7 199 aa20.2■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 TIFABQ6ZNK6 161 aa20.2■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 NEIL3Q8TAT5 605 aa20.2■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 SPPL2AQ8TCT8 520 aa20.2■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 SLC6A15Q9H2J7 730 aa20.2■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 SNX6Q9UNH7 406 aa20.2■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa20.2■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 LRATO95237 230 aa20.19■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 PORP16435 677 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 GPX3P22352 226 aa20.19■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 KIR2DL3P43628 341 aa20.19■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 CDH13P55290 713 aa20.19■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 FBXW4P57775 412 aa20.19■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 C6orf163Q5TEZ5 329 aa20.19■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa20.19■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 TMEM64Q6YI46 380 aa20.19■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 CAMKMTQ7Z624 323 aa20.19■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 LCA5Q86VQ0 697 aa20.19■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 VWA5B2Q8N398 1253 aa20.19■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 SELENOMQ8WWX9 145 aa20.19■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 ZNF592Q92610 1267 aa20.19■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 DIO2Q92813 273 aa20.19■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 MBD6Q96DN6 1003 aa20.19■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 MTBPQ96DY7 904 aa20.19■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 UBQLN3Q9H347 655 aa20.19■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 DNHD1Q96M86 4753 aa20.19■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 GOLGA6L10A6NI86 522 aa20.18■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 HSD3B1P14060 373 aa20.18■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 NT5EP21589 574 aa20.18■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 HSD3B2P26439 372 aa20.18■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 ADH7P40394 386 aa20.18■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 DGKQP52824 942 aa20.18■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 NRG3P56975 720 aa20.18■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 ADAM8P78325 824 aa20.18■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 CLCQ05315 142 aa20.18■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 MGAT2Q10469 447 aa20.18■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa20.18■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 SGO1Q5FBB7 561 aa20.18■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 FNDC7Q5VTL7 733 aa20.18■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 BIVMQ86UB2 503 aa20.18■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 ZNF382Q96SR6 550 aa20.18■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 ANGPTL4Q9BY76 406 aa20.18■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 EXO5Q9H790 373 aa20.18■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 MAT2BQ9NZL9 334 aa20.18■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 ZNF639Q9UID6 485 aa20.18■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 DTX4Q9Y2E6 619 aa20.18■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 OR4F21O95013 312 aa20.17■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 SNX4O95219 450 aa20.17■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 TSPAN8P19075 237 aa20.17■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 ABCD3P28288 659 aa20.17■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 SOX18P35713 384 aa20.17■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 HSD17B3P37058 310 aa20.17■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 MAP4K2Q12851 820 aa20.17■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa20.17■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 LGSNQ5TDP6 509 aa20.17■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 FAM219BQ5XKK7 198 aa20.17■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 BICRALQ6AI39 1079 aa20.17■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 TMEM81Q6P7N7 255 aa20.17■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 PAMR1Q6UXH9 720 aa20.17■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 LIX1LQ8IVB5 337 aa20.17■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 ULK2Q8IYT8 1036 aa20.17■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 TM4SF18Q96CE8 201 aa20.17■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 CTHRC1Q96CG8 243 aa20.17■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 RILPQ96NA2 401 aa20.17■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 TMEM237Q96Q45 408 aa20.17■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 NMRK1Q9NWW6 199 aa20.17■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 CRIM1Q9NZV1 1036 aa20.17■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 TMEM216Q9P0N5 145 aa20.17■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 A6NNC1 897 aa20.16■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 HPNP05981 417 aa20.16■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 NAGAP17050 411 aa20.16■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 GDF1P27539 372 aa20.16■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 RPP38P78345 283 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
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