RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613246.4

PTPRJ-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 7,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-207ENST00000613246 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 APMAPQ9HDC9 416 aa17.8■□□□□ 0.44
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PTPRJ-207ENST00000613246 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa17.8■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 MEIS3P2A8K0S8 358 aa17.8■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 F5H5P2 479 aa17.8■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 CLDN7O95471 211 aa17.8■□□□□ 0.44
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PTPRJ-207ENST00000613246 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
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PTPRJ-207ENST00000613246 MYBPHLA2RUH7 354 aa17.8■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 SEC14L6B5MCN3 397 aa17.8■□□□□ 0.44
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PTPRJ-207ENST00000613246 S100A7P31151 101 aa17.8■□□□□ 0.44
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PTPRJ-207ENST00000613246 FUNDC2Q9BWH2 189 aa17.8■□□□□ 0.44
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PTPRJ-207ENST00000613246 S100A7AQ86SG5 101 aa17.79■□□□□ 0.44
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PTPRJ-207ENST00000613246 CD79AP11912 226 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 ARL16Q0P5N6 197 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 DFNA5O60443 496 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF43P17038 809 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 RAB28P51157 221 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 DDIT4LQ96D03 193 aa17.78■□□□□ 0.44
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