RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589318.5

DDX39A-209, Transcript of DExD-box helicase 39A, human

TSL 1 (best)

Gene DDX39A, Length 1,903 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX39A-209	ENST00000589318	ZCCHC8	Q6NZY4	707 aa	Known RBP	14.52	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	NATD1	Q8N6N6	113 aa		14.52	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	EXOSC8	Q96B26	276 aa	Known RBP	14.52	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		14.52	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	DSN1	Q9H410	356 aa		14.52	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	FAM60A	Q9NP50	221 aa		14.52	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318		V9GYQ6	96 aa		14.52	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		14.51	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	LOC105371267	A0A1B0GV96	52 aa		14.51	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	PGRMC2	O15173	223 aa		14.51	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	TPST1	O60507	370 aa		14.51	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	AIFM1	O95831	613 aa		14.51	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	PCMT1	P22061	227 aa		14.51	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	IST1	P53990	364 aa		14.51	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	TPD52	P55327	224 aa	Predicted RBP	14.51	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	BTN3A2	P78410	334 aa		14.51	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	ZNF45	Q02386	682 aa		14.51	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	CDK10	Q15131	360 aa		14.51	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	SHB	Q15464	509 aa		14.51	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	C14orf28	Q4W4Y0	310 aa		14.51	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	14.51	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	AGAP6	Q5VW22	663 aa		14.51	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	LYSMD4	Q5XG99	296 aa		14.51	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	C18orf63	Q68DL7	685 aa		14.51	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	ENPP6	Q6UWR7	440 aa		14.51	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		14.51	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	SLC25A45	Q8N413	288 aa		14.51	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	OR5AK3P	Q8NH89	298 aa		14.51	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	KLHL6	Q8WZ60	621 aa		14.51	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	NACC2	Q96BF6	587 aa		14.51	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	AGAP4	Q96P64	663 aa		14.51	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	TMEM121B	Q9BXQ6	578 aa	Predicted RBP	14.51	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	SIRT3	Q9NTG7	399 aa	Predicted RBP	14.51	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	DCAF13	Q9NV06	445 aa	Known RBP	14.51	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	FBXW2	Q9UKT8	454 aa		14.51	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	CES1P1	Q9UKY3	287 aa		14.51	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	MRPS2	Q9Y399	296 aa	Known RBP	14.51	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	PROM1	O43490	865 aa		14.51	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	TNFRSF21	O75509	655 aa		14.51	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	DLGAP3	O95886	979 aa		14.51	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	ALPL	P05186	524 aa		14.51	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	PROS1	P07225	676 aa		14.51	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	MVK	Q03426	396 aa		14.51	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	TGM3	Q08188	693 aa		14.51	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		14.51	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	CAMKV	Q8NCB2	501 aa		14.51	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	CHDH	Q8NE62	594 aa	Predicted RBP	14.51	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	OR52N2	Q8NGI0	321 aa		14.51	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	PSMA8	Q8TAA3	256 aa		14.51	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	OR5P2	Q8WZ92	322 aa		14.51	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	RORB	Q92753	470 aa		14.51	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	SEPHS2	Q99611	448 aa		14.51	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	MAPKAP1	Q9BPZ7	522 aa		14.51	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	FAIM2	Q9BWQ8	316 aa		14.51	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		14.51	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	LDHAL6B	Q9BYZ2	381 aa	Predicted RBP	14.51	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	14.51	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	USE1	Q9NZ43	259 aa		14.51	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		14.51	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	GLOD5	A6NK44	160 aa		14.5	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	LAMTOR5	O43504	91 aa		14.5	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	SNX4	O95219	450 aa		14.5	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	APOA1	P02647	267 aa		14.5	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	14.5	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	DHPS	P49366	369 aa	Predicted RBP	14.5	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	14.5	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	FADD	Q13158	208 aa		14.5	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	MLC1	Q15049	377 aa		14.5	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	ERICH5	Q6P6B1	374 aa		14.5	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		14.5	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	C19orf47	Q8N9M1	422 aa	Known RBP	14.5	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	POC5	Q8NA72	575 aa		14.5	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	FBXO30	Q8TB52	745 aa		14.5	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	ZCCHC10	Q8TBK6	192 aa		14.5	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	PROX1	Q92786	737 aa		14.5	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	FAM162A	Q96A26	154 aa		14.5	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	YIPF6	Q96EC8	236 aa		14.5	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	SLC38A3	Q99624	504 aa		14.5	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		14.5	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	IL21R	Q9HBE5	538 aa		14.5	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	SLC35C2	Q9NQQ7	365 aa		14.5	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		14.5	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	UTS2R	Q9UKP6	389 aa		14.5	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	14.5	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	NCOR1	O75376	2440 aa		14.5	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		14.5	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		14.5	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318		A8MU76	341 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	B4GALT2	O60909	372 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	DNAJB6	O75190	326 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	MT-ND1	P03886	318 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	CTSB	P07858	339 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	ETFA	P13804	333 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	DDX5	P17844	614 aa	Known RBP	14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	IL1RN	P18510	177 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	UQCRC2	P22695	453 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	ACVR2A	P27037	513 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	UGT2B10	P36537	528 aa		14.49	□□□□□ -0.09

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