RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TWSG1Q9GZX9 223 aa15.54■□□□□ 0.08
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C11orf16Q9NQ32 467 aa15.53■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa15.53■□□□□ 0.08
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MAN2A2P49641 1150 aa15.52■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RGS6P49758 472 aa15.52■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP15.52■□□□□ 0.08
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa15.52■□□□□ 0.07
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 A6NCN8 305 aa15.51■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 METTL15A6NJ78 407 aa15.51■□□□□ 0.07
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NR2F6P10588 404 aa15.51■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MC3RP41968 323 aa15.51■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HTR4Q13639 388 aa15.51■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KIR2DS3Q14952 304 aa15.51■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 INAQ16352 499 aa15.51■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF404Q494X3 552 aa15.51■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TPRG1LQ5T0D9 272 aa15.51■□□□□ 0.07
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