RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582955.5

SMARCE1-218, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 5

Gene SMARCE1, Length 621 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-218ENST00000582955 OSGIN2Q9Y236 505 aa11.64□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 CFL2Q9Y281 166 aa11.64□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 TMED5Q9Y3A6 229 aa11.64□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 SVILO95425 2214 aa11.64□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 CROCCQ5TZA2 2017 aa11.64□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 TFECO14948 347 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 CBX7O95931 251 aa11.63□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 JUNP05412 331 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 CCL3P10147 92 aa11.63□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 GPX3P22352 226 aa11.63□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 MAPK1P28482 360 aa11.63□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 NRG3P56975 720 aa11.63□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 PLGLB1Q02325 96 aa11.63□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 DUSP8Q13202 625 aa11.63□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 NNATQ16517 81 aa11.63□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 PRSS53Q2L4Q9 553 aa11.63□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 XKR7Q5GH72 579 aa11.63□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa11.63□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 LYPD8Q6UX82 237 aa11.63□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 TMEM64Q6YI46 380 aa11.63□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 FAM47EQ6ZV65 393 aa11.63□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 PRR22Q8IZ63 422 aa11.63□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 ZNF441Q8N8Z8 693 aa11.63□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 SIMC1Q8NDZ2 872 aa11.63□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 OR5M3Q8NGP4 307 aa11.63□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 ZNF675Q8TD23 568 aa11.63□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 TP53INP1Q96A56 240 aa11.63□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 CTHRC1Q96CG8 243 aa11.63□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 TLCD1Q96CP7 247 aa11.63□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 TUBGCP3Q96CW5 907 aa11.63□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 PPP1R36Q96LQ0 422 aa11.63□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 C3orf30Q96M34 536 aa11.63□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 ITPAQ9BY32 194 aa11.63□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 ANKRA2Q9H9E1 313 aa11.63□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 SACM1LQ9NTJ5 587 aa11.63□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 DEPPQ9NTK1 212 aa11.63□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 PRODH2Q9UF12 536 aa11.63□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa11.63□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 DTX4Q9Y2E6 619 aa11.63□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 RAP2CQ9Y3L5 183 aa11.63□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 A0A0G2JMM0 328 aa11.62□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 A0A1W2PPB8 328 aa11.62□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 A0A1W2PRS3 328 aa11.62□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 PINLYPA6NC86 204 aa11.62□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 KIR3DP1A8MWS1 328 aa11.62□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 CAPN14A8MX76 684 aa11.62□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 MYO1GB0I1T2 1018 aa11.62□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 SEMA7AO75326 666 aa11.62□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 WISP2O76076 250 aa11.62□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 FBXO45P0C2W1 286 aa11.62□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 BCKDHAP12694 445 aa11.62□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 CNR1P21554 472 aa11.62□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 SOX18P35713 384 aa11.62□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 ASMTP46597 345 aa11.62□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 TMED10P49755 219 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 WDR4P57081 412 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 RBPJQ06330 500 aa11.62□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP11.62□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 BST1Q10588 318 aa11.62□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 CEBPEQ15744 281 aa11.62□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 RNFT1Q5M7Z0 435 aa11.62□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 PRAMEF20Q5VT98 475 aa11.62□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 SLC22A10Q63ZE4 541 aa11.62□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 GK5Q6ZS86 529 aa11.62□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 LIX1Q8N485 282 aa11.62□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 FNDC5Q8NAU1 212 aa11.62□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 OR2M7Q8NG81 312 aa11.62□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 OR10G3Q8NGC4 313 aa11.62□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 ADIPOR1Q96A54 375 aa11.62□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 PPCDCQ96CD2 204 aa11.62□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 GPR137Q96N19 417 aa11.62□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 FAM173AQ9BQD7 235 aa11.62□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 C1orf50Q9BV19 199 aa11.62□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 C20orf27Q9GZN8 174 aa11.62□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 GLIPR2Q9H4G4 154 aa11.62□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 REEP4Q9H6H4 257 aa11.62□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 TAS2R7Q9NYW3 318 aa11.62□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 SH3BP4Q9P0V3 963 aa11.62□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa11.62□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 CLEC18AA5D8T8 446 aa11.61□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 FAM166BA8MTA8 275 aa11.61□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 ACOT7O00154 380 aa11.61□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 TP53I11O14683 189 aa11.61□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 PDPK1O15530 556 aa11.61□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 ASNA1O43681 348 aa11.61□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 HS6ST1O60243 411 aa11.61□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 HPCAL1P37235 193 aa11.61□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 PIGAP37287 484 aa11.61□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 MC3RP41968 323 aa11.61□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 DNASE1L1P49184 302 aa11.61□□□□□ -0.55
SMARCE1-218ENST00000582955 EMDP50402 254 aa11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms