RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582232.1

GGA3-211, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene GGA3, Length 598 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-211ENST00000582232 NFYCQ13952 458 aa10.71□□□□□ -0.69
GGA3-211ENST00000582232 RUNDC3AQ59EK9 446 aa10.71□□□□□ -0.69
GGA3-211ENST00000582232 SAXO2Q658L1 398 aa10.71□□□□□ -0.69
GGA3-211ENST00000582232 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
GGA3-211ENST00000582232 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa10.71□□□□□ -0.69
GGA3-211ENST00000582232 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa10.71□□□□□ -0.69
GGA3-211ENST00000582232 ZNF621Q6ZSS3 439 aa10.71□□□□□ -0.69
GGA3-211ENST00000582232 DHDDSQ86SQ9 333 aa10.71□□□□□ -0.69
GGA3-211ENST00000582232 MSRB3Q8IXL7 192 aa10.71□□□□□ -0.69
GGA3-211ENST00000582232 NUP43Q8NFH3 380 aa10.71□□□□□ -0.69
GGA3-211ENST00000582232 OR8K3Q8NH51 312 aa10.71□□□□□ -0.69
GGA3-211ENST00000582232 ELP5Q8TE02 316 aa10.71□□□□□ -0.69
GGA3-211ENST00000582232 ZFP90Q8TF47 636 aa10.71□□□□□ -0.69
GGA3-211ENST00000582232 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
GGA3-211ENST00000582232 LRRC58Q96CX6 371 aa10.71□□□□□ -0.69
GGA3-211ENST00000582232 NEURL3Q96EH8 262 aa10.71□□□□□ -0.69
GGA3-211ENST00000582232 GIMAP5Q96F15 307 aa10.71□□□□□ -0.69
GGA3-211ENST00000582232 VMP1Q96GC9 406 aa10.71□□□□□ -0.69
GGA3-211ENST00000582232 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
GGA3-211ENST00000582232 CGREF1Q99674 301 aa10.71□□□□□ -0.69
GGA3-211ENST00000582232 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
GGA3-211ENST00000582232 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
GGA3-211ENST00000582232 CNPPD1Q9BV87 410 aa10.71□□□□□ -0.69
GGA3-211ENST00000582232 OR10A5Q9H207 317 aa10.71□□□□□ -0.69
GGA3-211ENST00000582232 C1orf21Q9H246 121 aa10.71□□□□□ -0.69
GGA3-211ENST00000582232 MMP25Q9NPA2 562 aa10.71□□□□□ -0.69
GGA3-211ENST00000582232 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
GGA3-211ENST00000582232 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP10.71□□□□□ -0.69
GGA3-211ENST00000582232 GPATCH2Q9NW75 528 aa10.71□□□□□ -0.69
GGA3-211ENST00000582232 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa10.71□□□□□ -0.69
GGA3-211ENST00000582232 VAPAQ9P0L0 249 aa10.71□□□□□ -0.69
GGA3-211ENST00000582232 COPS7AQ9UBW8 275 aa10.71□□□□□ -0.69
GGA3-211ENST00000582232 FBXL4Q9UKA2 621 aa10.71□□□□□ -0.69
GGA3-211ENST00000582232 CFL2Q9Y281 166 aa10.71□□□□□ -0.69
GGA3-211ENST00000582232 SNX8Q9Y5X2 465 aa10.71□□□□□ -0.69
GGA3-211ENST00000582232 LAMA5O15230 3695 aa10.71□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 DOCK10Q96BY6 2186 aa10.7□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa10.7□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 TTC36A6NLP5 189 aa10.7□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 AIM2O14862 343 aa10.7□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 PRAMEF2O60811 474 aa10.7□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 ATP5HO75947 161 aa10.7□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 SOX30O94993 753 aa10.7□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 KRT75O95678 551 aa10.7□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 GSNP06396 782 aa10.7□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 KRT16P08779 473 aa10.7□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 SSTR4P31391 388 aa10.7□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 MAP3K8P41279 467 aa10.7□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 EMDP50402 254 aa10.7□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 PGDP52209 483 aa10.7□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 AP2B1P63010 937 aa10.7□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 ATP1A4Q13733 1029 aa10.7□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 SPDYE7PQ495Y7 208 aa10.7□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 RNF111Q6ZNA4 994 aa10.7□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 GPR155Q7Z3F1 870 aa10.7□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 C6orf120Q7Z4R8 191 aa10.7□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 PROSER1Q86XN7 944 aa10.7□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 SPACA3Q8IXA5 215 aa10.7□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 SIMC1Q8NDZ2 872 aa10.7□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 MIPOL1Q8TD10 442 aa10.7□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 NCLNQ969V3 563 aa10.7□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa10.7□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 ANKRD27Q96NW4 1050 aa10.7□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 MS4A4EQ96PG1 132 aa10.7□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 SLC35A5Q9BS91 424 aa10.7□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 NUDT9Q9BW91 350 aa10.7□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 OR8D2Q9GZM6 311 aa10.7□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 ANKRA2Q9H9E1 313 aa10.7□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 TPT1P8Q9HAU6 139 aa10.7□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 GIN1Q9NXP7 522 aa10.7□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 NDE1Q9NXR1 346 aa10.7□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 PRODH2Q9UF12 536 aa10.7□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 TPRP12270 2363 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 MED13Q9UHV7 2174 aa10.7□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 A0A087WV48 116 aa10.69□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa10.69□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 CDC14CA4D256 554 aa10.69□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa10.69□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 CLIC1O00299 241 aa10.69□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 NKX2-8O15522 239 aa10.69□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 UNC5CO95185 931 aa10.69□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 SERPINA7P05543 415 aa10.69□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 C1QTNF9P0C862 333 aa10.69□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 GPX2P18283 190 aa10.69□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 SOAT1P35610 550 aa10.69□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 CPOXP36551 454 aa10.69□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 PRIM2P49643 509 aa10.69□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 NUDT2P50583 147 aa10.69□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 CLCN2P51788 898 aa10.69□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 MVDP53602 400 aa10.69□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 SOX8P57073 446 aa10.69□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 CDC20Q12834 499 aa10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms