RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	CDYL2	Q8N8U2	506 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	FAM47B	Q8NA70	645 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	SLC2A12	Q8TD20	617 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	PAQR8	Q8TEZ7	354 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	SPACA9	Q96E40	222 aa	Predicted RBP	6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	ARSG	Q96EG1	525 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	HSPBAP1	Q96EW2	488 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	RBM18	Q96H35	190 aa	Known RBP	6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	ART5	Q96L15	291 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	QRFPR	Q96P65	431 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	F2RL3	Q96RI0	385 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	CNPPD1	Q9BV87	410 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	ERVK-6	Q9BXR3	956 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	OR51B5	Q9H339	312 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	GSTO2	Q9H4Y5	243 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	ZNF703	Q9H7S9	590 aa	Predicted RBP	6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	ZNF395	Q9H8N7	513 aa	Predicted RBP	6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	COPS7B	Q9H9Q2	264 aa	Predicted RBP	6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	LYRM4	Q9HD34	91 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	SH2D2A	Q9NP31	389 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	MID1IP1	Q9NPA3	183 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	FARSB	Q9NSD9	589 aa	Known RBP	6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	SDAD1	Q9NVU7	687 aa	Known RBP eCLIP	6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	SPRR3	Q9UBC9	169 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	ZNF490	Q9ULM2	529 aa	Predicted RBP	6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	TIMM22	Q9Y584	194 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	PTGDR2	Q9Y5Y4	395 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	SPACA6	W5XKT8	324 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	6.3	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	ABCA4	P78363	2273 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	ITPR3	Q14573	2671 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	TMEM120B	A0PK00	339 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	CCDC189	A1A4V9	331 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	CD8B2	A6NJW9	211 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	CLCA1	A8K7I4	914 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	CAPN14	A8MX76	684 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	TMEM233	B4DJY2	109 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	TGFBR3L	H3BV60	316 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	UBFD1	O14562	309 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	PRKRA	O75569	313 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	CRCP	O75575	148 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	CLDN9	O95484	217 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	ETHE1	O95571	254 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	TBX6	O95947	436 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	GBA	P04062	536 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	NEFH	P12036	1026 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	CHN1	P15882	459 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	IMPDH1	P20839	514 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	ENDOU	P21128	410 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	BGN	P21810	368 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	CTSS	P25774	331 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	CERS1	P27544	350 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	SERPINB3	P29508	390 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	PIGA	P37287	484 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	HNRNPF	P52597	415 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	DCAF7	P61962	342 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	ASPH	Q12797	758 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	DUSP8	Q13202	625 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	PAGE2B	Q5JRK9	111 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	CFAP157	Q5JU67	520 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	CDKL4	Q5MAI5	379 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	LIPM	Q5VYY2	423 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	NSUN5P2	Q63ZY6	315 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	TMEM198	Q66K66	360 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	CLEC6A	Q6EIG7	209 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	HIST2H2AA3	Q6FI13	130 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	MED27	Q6P2C8	311 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	GPRIN3	Q6ZVF9	776 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	CHSY3	Q70JA7	882 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	MILR1	Q7Z6M3	343 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	LRRC75A-AS1	Q8N1F1	130 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	RELL2	Q8NC24	303 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	TMEM52	Q8NDY8	209 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	OR7G3	Q8NG95	312 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	ZNF721	Q8TF20	911 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	NUDT8	Q8WV74	236 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	SMPDL3B	Q92485	455 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	PIGT	Q969N2	578 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	NTNG2	Q96CW9	530 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	PGM2	Q96G03	612 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	SENP5	Q96HI0	755 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	PPP1R36	Q96LQ0	422 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	DACH2	Q96NX9	599 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	KCNC2	Q96PR1	638 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	TIMP4	Q99727	224 aa		6.29	□□□□□ -1.4

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