RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551936.5

CS-229, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 744 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-229ENST00000551936 ZNF597Q96LX8 424 aa13.27□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 ZNF681Q96N22 645 aa13.27□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 RILPQ96NA2 401 aa13.27□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 TMEM237Q96Q45 408 aa13.27□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 HBEGFQ99075 208 aa13.27□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 BRINP2Q9C0B6 783 aa13.27□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 NMRK1Q9NWW6 199 aa13.27□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 MAT2BQ9NZL9 334 aa13.27□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 VPS29Q9UBQ0 182 aa13.27□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 MANBAO00462 879 aa13.26□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 HPNP05981 417 aa13.26□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 HSD3B1P14060 373 aa13.26□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 CHN1P15882 459 aa13.26□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 IMPDH1P20839 514 aa13.26□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 HSD3B2P26439 372 aa13.26□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 ABCD3P28288 659 aa13.26□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 TMED10P49755 219 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa13.26□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 C6orf163Q5TEZ5 329 aa13.26□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 FAM180BQ6P0A1 224 aa13.26□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 SEM1Q6ZVN7 128 aa13.26□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 ULK2Q8IYT8 1036 aa13.26□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 VWA5B2Q8N398 1253 aa13.26□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 LIX1Q8N485 282 aa13.26□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 CDYL2Q8N8U2 506 aa13.26□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 SIMC1Q8NDZ2 872 aa13.26□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 TMEM41AQ96HV5 264 aa13.26□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 GNRHR2Q96P88 292 aa13.26□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 UBQLN3Q9H347 655 aa13.26□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 HEY2Q9UBP5 337 aa13.26□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 B4GALT7Q9UBV7 327 aa13.26□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa13.26□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 PSME2Q9UL46 239 aa13.26□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 CFL2Q9Y281 166 aa13.26□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 OTOGQ6ZRI0 2925 aa13.26□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 PPM1BO75688 479 aa13.25□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 CBX7O95931 251 aa13.25□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 NAGAP17050 411 aa13.25□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 CDK9P50750 372 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 RPP38P78345 283 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 RAE1P78406 368 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 RASA2Q15283 850 aa13.25□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 DESI1Q6ICB0 168 aa13.25□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 TMEM81Q6P7N7 255 aa13.25□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 PACS2Q86VP3 889 aa13.25□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 LCA5Q86VQ0 697 aa13.25□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 IFT20Q8IY31 132 aa13.25□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 CEP112Q8N8E3 955 aa13.25□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 ADCY4Q8NFM4 1077 aa13.25□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 HGDQ93099 445 aa13.25□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 KLHL29Q96CT2 875 aa13.25□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 HSPBAP1Q96EW2 488 aa13.25□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 ZNF382Q96SR6 550 aa13.25□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 TIMP4Q99727 224 aa13.25□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 FAIM2Q9BWQ8 316 aa13.25□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 ITPAQ9BY32 194 aa13.25□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 TXLNGYQ9BZA5 131 aa13.25□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 BCAP29Q9UHQ4 241 aa13.25□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 MCM8Q9UJA3 840 aa13.25□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 PLLPQ9Y342 182 aa13.25□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa13.24□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 AHRRA9YTQ3 701 aa13.24□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa13.24□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 GNB5O14775 395 aa13.24□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 ULK1O75385 1050 aa13.24□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 TRAPPC6AO75865 159 aa13.24□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 EPPINO95925 133 aa13.24□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 KRT6AP02538 564 aa13.24□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 KRT6BP04259 564 aa13.24□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 FAM153BP0C7A2 387 aa13.24□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 KRT15P19012 456 aa13.24□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 PTGDSP41222 190 aa13.24□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 KRT6CP48668 564 aa13.24□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 ALDH9A1P49189 494 aa13.24□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 EMDP50402 254 aa13.24□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 HTR6P50406 440 aa13.24□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 PRKAA2P54646 552 aa13.24□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 DLX5P56178 289 aa13.24□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 SLC29A2Q14542 456 aa13.24□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 LTB4RQ15722 352 aa13.24□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 FAM153CQ494X1 144 aa13.24□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa13.24□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 NUP54Q7Z3B4 507 aa13.24□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 SLC22A9Q8IVM8 553 aa13.24□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 CCDC116Q8IYX3 515 aa13.24□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 CLYBLQ8N0X4 340 aa13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms