RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 STOML2Q9UJZ1 356 aa9□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 SLC6A14Q9UN76 642 aa9□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 AQP12BA6NM10 295 aa9□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 C2CD4DB7Z1M9 353 aa9□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 KCNK5O95279 499 aa9□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 IFNA21P01568 189 aa9□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 PRH1P02810 166 aa9□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 C1SP09871 688 aa9□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 NR4A1P22736 598 aa9□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 MAGEA8P43361 318 aa9□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 ALG10Q5BKT4 473 aa9□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 BCL2L15Q5TBC7 163 aa9□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 SLC25A25Q6KCM7 469 aa9□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 AQP12AQ8IXF9 295 aa9□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 IQCKQ8N0W5 287 aa9□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 SLC44A3Q8N4M1 653 aa9□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 OR51A7Q8NH64 312 aa9□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 IL26Q9NPH9 171 aa9□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 NANSQ9NR45 359 aa9□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 RXFP3Q9NSD7 469 aa9□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 MKLN1Q9UL63 735 aa9□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 H0YJX3 145 aa9□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 SULT2B1O00204 365 aa9□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 WDPCPO95876 746 aa9□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 DDCP20711 480 aa9□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 OR1D4P47884 311 aa9□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 SLC6A8P48029 635 aa9□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 PSMD7P51665 324 aa9□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 OR1D5P58170 312 aa9□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 HSD11B2P80365 405 aa9□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 PPP1R3AQ16821 1122 aa9□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 C4orf46Q504U0 113 aa9□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa9□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 RAB11FIP2Q7L804 512 aa9□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 ZSWIM9Q86XI8 627 aa9□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa9□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF619Q8N2I2 560 aa9□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 GALNT6Q8NCL4 622 aa9□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 OR52R1Q8NGF1 315 aa9□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 OR9I1Q8NGQ6 314 aa9□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 EDEM2Q9BV94 578 aa9□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 HDAC8Q9BY41 377 aa9□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 DNTTIP1Q9H147 329 aa9□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 NFS1Q9Y697 457 aa9□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 ANHXE9PGG2 379 aa9□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 FAAHO00519 579 aa9□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 LPLP06858 475 aa9□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 CREB1P16220 341 aa9□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 SSR4P51571 173 aa9□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 OR7A5Q15622 319 aa9□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 FAM180BQ6P0A1 224 aa9□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 LEG1Q6P5S2 330 aa9□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 NEDD4LQ96PU5 975 aa9□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 C1orf21Q9H246 121 aa9□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 SRFP11831 508 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 MAGP20916 626 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 ACVR1BP36896 505 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 GSK3BP49841 420 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 RIDAP52758 137 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 UNC50Q53HI1 259 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 C1orf220Q5T0J3 134 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 ATG9BQ674R7 924 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 UTS2BQ765I0 119 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 SCML4Q8N228 414 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 OR2T33Q8NG76 320 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 SPTSSAQ969W0 71 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 MUCL1Q96DR8 90 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 ASB9Q96DX5 294 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 KCNIP1Q9NZI2 227 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 FABP12A6NFH5 140 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 EI24O14681 340 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 MPPED1O15442 326 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 F10P00742 488 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 APOC1P02654 83 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF806P0C7X5 589 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 UBL4AP11441 157 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 UGT2B7P16662 529 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 GSTM2P28161 218 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 FADDQ13158 208 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 ALG10BQ5I7T1 473 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 OR51Q1Q8NH59 317 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 RDH14Q9HBH5 336 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 ZBTB26Q9HCK0 441 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 C5AR2Q9P296 337 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 ACSL6Q9UKU0 697 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 CTHP32929 405 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 THBS2P35442 1172 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 POU3F4P49335 361 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 CTC1Q2NKJ3 1217 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 CHRFAM7AQ494W8 412 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 C6orf136Q5SQH8 315 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 LRFN4Q6PJG9 635 aa8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.4 ms