RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515749.1

SEC31A-241, Transcript of SEC31 homolog A, COPII coat complex component, humanhuman

TSL 2

Gene SEC31A, Length 829 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31A-241ENST00000515749 IFI44LQ53G44 452 aa7.05□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 ATAD3BQ5T9A4 648 aa7.05□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 OR2T5Q6IEZ7 315 aa7.05□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 GPR135Q8IZ08 494 aa7.05□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 LGI4Q8N135 537 aa7.05□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 CLEC4FQ8N1N0 589 aa7.05□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 OR2L13Q8N349 312 aa7.05□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 GALNT4Q8N4A0 578 aa7.05□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 CBR4Q8N4T8 237 aa7.05□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 HORMAD2Q8N7B1 307 aa7.05□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 TMEM105Q8N8V8 129 aa7.05□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 NUP43Q8NFH3 380 aa7.05□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 OR2T29Q8NH02 315 aa7.05□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 NFKBIDQ8NI38 313 aa7.05□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 BBS10Q8TAM1 723 aa7.05□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 SLC38A5Q8WUX1 472 aa7.05□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 UCN3Q969E3 161 aa7.05□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 TMBIM1Q969X1 311 aa7.05□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 VPS50Q96JG6 964 aa7.05□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 HSH2DQ96JZ2 352 aa7.05□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 ZNF570Q96NI8 536 aa7.05□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 OR1F2PQ96R84 312 aa7.05□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 CIB1Q99828 191 aa7.05□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 SPOCK3Q9BQ16 436 aa7.05□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 GAREM1Q9H706 876 aa7.05□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 THSD1Q9NS62 852 aa7.05□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 USE1Q9NZ43 259 aa7.05□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 OAZ3Q9UMX2 235 aa7.05□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa7.05□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa7.05□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 ASXL3Q9C0F0 2248 aa7.05□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 SEC16AO15027 2179 aa7.04□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 DCDC2BA2VCK2 349 aa7.04□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 FAM149AA5PLN7 773 aa7.04□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 SAC3D1A6NKF1 404 aa7.04□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 WASHC1A8K0Z3 465 aa7.04□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 A8MVJ9 347 aa7.04□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 H3BMH7 237 aa7.04□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 SGK494L7N484 410 aa7.04□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 SOCS2O14508 198 aa7.04□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 ADAMDEC1O15204 470 aa7.04□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 CASC3O15234 703 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 FOXS1O43638 330 aa7.04□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 E2F6O75461 281 aa7.04□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 OR2B3O76000 313 aa7.04□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 AK1P00568 194 aa7.04□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 CFIP05156 583 aa7.04□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 RPSAP08865 295 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 SP9P0CG40 484 aa7.04□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 NR2F1P10589 423 aa7.04□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 CKMT1AP12532 417 aa7.04□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 CKMT2P17540 419 aa7.04□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 RPS6KA3P51812 740 aa7.04□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 GFERP55789 205 aa7.04□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 ITGA1P56199 1179 aa7.04□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 SHC2P98077 582 aa7.04□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 ACY1Q03154 408 aa7.04□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 MAP4K2Q12851 820 aa7.04□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 DAG1Q14118 895 aa7.04□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 SERTAD2Q14140 314 aa7.04□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 C16orf72Q14CZ0 275 aa7.04□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 NKG7Q16617 165 aa7.04□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 ZNF628Q5EBL2 1059 aa7.04□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 NHSL2Q5HYW2 709 aa7.04□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 NKAIN2Q5VXU1 208 aa7.04□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 AP1ARQ63HQ0 302 aa7.04□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 FAM180BQ6P0A1 224 aa7.04□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 CDC73Q6P1J9 531 aa7.04□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 TMEM107Q6UX40 140 aa7.04□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 DHRSXQ8N5I4 330 aa7.04□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 FAM86B1Q8N7N1 296 aa7.04□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 CDRT4Q8N9R6 151 aa7.04□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 OR4D9Q8NGE8 314 aa7.04□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 OR9A2Q8NGT5 310 aa7.04□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 OR9A4Q8NGU2 314 aa7.04□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 ADAMTS15Q8TE58 950 aa7.04□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 XAGE5Q8WWM1 108 aa7.04□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 NR4A3Q92570 626 aa7.04□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 GATA6Q92908 595 aa7.04□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 MAL2Q969L2 176 aa7.04□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 TAMM41Q96BW9 452 aa7.04□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 TMEM19Q96HH6 336 aa7.04□□□□□ -1.28
SEC31A-241ENST00000515749 TPD52L3Q96J77 140 aa7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms