RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511978.5

MATR3-218, Transcript of matrin 3, human

TSL 3

Gene MATR3, Length 573 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MATR3-218	ENST00000511978	ANKRD20A2	Q5SQ80	823 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	ANKRD20A1	Q5TYW2	823 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	ANKRD20A3	Q5VUR7	823 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	ALS2CL	Q60I27	953 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	RAET1G	Q6H3X3	334 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	PNCK	Q6P2M8	343 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	KDELC1	Q6UW63	502 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	RFLNA	Q6ZTI6	216 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	TUBA1A	Q71U36	451 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	HIST3H2A	Q7L7L0	130 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	PID1	Q7Z2X4	250 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	GLRX5	Q86SX6	157 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	SLC13A5	Q86YT5	568 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	NAGS	Q8N159	534 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	EID2	Q8N6I1	236 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	OR8K5	Q8NH50	307 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	THAP6	Q8TBB0	222 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	CCDC110	Q8TBZ0	833 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	HM13	Q8TCT9	377 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	PIGT	Q969N2	578 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	AP2M1	Q96CW1	435 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	PDXP	Q96GD0	296 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	OXNAD1	Q96HP4	312 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	SPATA13	Q96N96	652 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	QRFPR	Q96P65	431 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	PKP4	Q99569	1192 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	TUBA1C	Q9BQE3	449 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	APOO	Q9BUR5	198 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	MLPH	Q9BV36	600 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	LRRC61	Q9BV99	259 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	CARD9	Q9H257	536 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	TCEAL2	Q9H3H9	227 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	GHITM	Q9H3K2	345 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	PLK3	Q9H4B4	646 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	EPB41L5	Q9HCM4	733 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	FGF22	Q9HCT0	170 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	KLHL1	Q9NR64	748 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	NLGN3	Q9NZ94	848 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	PKD2L2	Q9NZM6	624 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	APOBEC3B	Q9UH17	382 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	KLHL20	Q9Y2M5	609 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	CEP250	Q9BV73	2442 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	MYLK	Q15746	1914 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	LOC285095	A0A1B0GVY8	99 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	EIF4E1B	A6NMX2	242 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	MAP2K7	O14733	419 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	HS3ST1	O14792	307 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	ANKRD28	O15084	1053 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	OGG1	O15527	345 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	ZSCAN12	O43309	604 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	AQP9	O43315	295 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	HS6ST1	O60243	411 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	ANXA9	O76027	345 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	LDOC1	O95751	146 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	FGF1	P05230	155 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	ALPPL2	P10696	532 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	HLA-DPA1	P20036	260 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	TEAD1	P28347	426 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	TRIM23	P36406	574 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	PSMB10	P40306	273 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	GPR1	P46091	355 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	SPINT3	P49223	89 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	CAMP	P49913	170 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	GPR143	P51810	404 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	GEM	P55040	296 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	DCDC1	P59894	354 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	SRP54	P61011	504 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	HNRNPK	P61978	463 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	PPARD	Q03181	441 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	DNAJC3	Q13217	504 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	PRPSAP1	Q14558	356 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	IRF3	Q14653	427 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	SLC1A5	Q15758	541 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	HENMT1	Q5T8I9	393 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	KCTD16	Q68DU8	428 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	DOK6	Q6PKX4	331 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	ENPP7	Q6UWV6	458 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	GPR180	Q86V85	440 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	SLC25A45	Q8N413	288 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	OR4C6	Q8NH72	309 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	BBS10	Q8TAM1	723 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	LMX1A	Q8TE12	382 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	OR1E3	Q8WZA6	343 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	PPP1R2P1	Q96PQ5	205 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	FICD	Q9BVA6	458 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	RIOK2	Q9BVS4	552 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-218	ENST00000511978	ABCG8	Q9H221	673 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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