RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497037.5

ANKRD28-212, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 3,509 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-212ENST00000497037 MIPOL1Q8TD10 442 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 XAGE5Q8WWM1 108 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 PIK3R3Q92569 461 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 BBS4Q96RK4 519 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 EPYCQ99645 322 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 MAT2BQ9NZL9 334 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 SCOCQ9UIL1 159 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 GXYLT2A0PJZ3 443 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 OR5K4A6NMS3 321 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 CHST10O43529 356 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 DNAJB5O75953 348 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 KRT75O95678 551 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 CPMP14384 443 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 PTNP21246 168 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 FPR1P21462 350 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 CDH3P22223 829 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 PAX7P23759 505 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 CD1CP29017 333 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 GPC1P35052 558 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 NUDT1P36639 197 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 PRIM2P49643 509 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 MVKQ03426 396 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 RGS1Q08116 209 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 ELOCQ15369 112 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 TEAD4Q15561 434 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 SPDYE7PQ495Y7 208 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 LIN52Q52LA3 116 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 IFI44LQ53G44 452 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 XAF1Q6GPH4 301 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 MFSD12Q6NUT3 480 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 USP53Q70EK8 1073 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 ZNF786Q8N393 782 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 CLIP4Q8N3C7 705 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 TRIML2Q8N7C3 387 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 ARL10Q8N8L6 244 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 TMEM105Q8N8V8 129 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 OR4N2Q8NGD1 307 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 OR6T1Q8NGN1 323 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 SFXN5Q8TD22 340 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 COL26A1Q96A83 441 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 ZNF524Q96C55 264 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 CTHRC1Q96CG8 243 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 SHDQ96IW2 340 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 DHRS1Q96LJ7 313 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 KLHDC3Q9BQ90 382 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 NUDT22Q9BRQ3 303 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 SMOC1Q9H4F8 434 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 UCK1Q9HA47 277 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 BATF3Q9NR55 127 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 CTPS2Q9NRF8 586 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 PNPLA3Q9NST1 481 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 ACAD8Q9UKU7 415 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 EML6Q6ZMW3 1958 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 H0YAE9 185 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 SLC16A6O15403 523 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 B3GALT2O43825 422 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 SLC28A2O43868 658 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 DPM1O60762 260 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 WBP4O75554 376 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 TNFAIP8O95379 198 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 GASTP01350 101 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 ITGAMP11215 1152 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 POU2F1P14859 743 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 FOLR1P15328 257 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 MAOAP21397 527 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 CBLP22681 906 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 PCSK6P29122 969 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 ALDH4A1P30038 563 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 NTSP30990 170 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 GSSP48637 474 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 HLCSP50747 726 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 SPIBQ01892 262 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 FAM53BQ14153 422 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 CNPY1Q3B7I2 92 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 TMEM236Q5W0B7 351 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 PMS2CLQ68D20 193 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 NPSR1Q6W5P4 371 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 GKN2Q86XP6 184 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 CCDC103Q8IW40 242 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-212ENST00000497037 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa4.51□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms