RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493752.5

ABCD4-216, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

TSL 3

Gene ABCD4, Length 719 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-216ENST00000493752 DRD5P21918 477 aa7.55□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 PTGER1P34995 402 aa7.55□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 SOX11P35716 441 aa7.55□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 MC3RP41968 323 aa7.55□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 CCT3P49368 545 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 EMDP50402 254 aa7.55□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 POLE2P56282 527 aa7.55□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 KCNK10P57789 538 aa7.55□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 DCAF7P61962 342 aa7.55□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 HBA1P69905 142 aa7.55□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 PRR5P85299 388 aa7.55□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 HSPB3Q12988 150 aa7.55□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 RCAN2Q14206 197 aa7.55□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 MEP1AQ16819 746 aa7.55□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 VPS26BQ4G0F5 336 aa7.55□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 AGKQ53H12 422 aa7.55□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 ACER2Q5QJU3 275 aa7.55□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 BHLHB9Q6PI77 547 aa7.55□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 TMEM107Q6UX40 140 aa7.55□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 ISLR2Q6UXK2 745 aa7.55□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 TMEM64Q6YI46 380 aa7.55□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 SLC29A4Q7RTT9 530 aa7.55□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 ANKS4BQ8N8V4 417 aa7.55□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 C17orf47Q8NEP4 570 aa7.55□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 FDCSPQ8NFU4 85 aa7.55□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 OR52R1Q8NGF1 315 aa7.55□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 C16orf52Q8NHV5 167 aa7.55□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 TTC9Q92623 222 aa7.55□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 TP53INP1Q96A56 240 aa7.55□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 MOAP1Q96BY2 351 aa7.55□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 WBP1Q96G27 269 aa7.55□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 CCDC115Q96NT0 180 aa7.55□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa7.55□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 SLC25A23Q9BV35 468 aa7.55□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 ADNPQ9H2P0 1102 aa7.55□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 NEUROD4Q9HD90 331 aa7.55□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 SLC52A3Q9NQ40 469 aa7.55□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 GPR83Q9NYM4 423 aa7.55□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 CCDC167Q9P0B6 97 aa7.55□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 MYOTQ9UBF9 498 aa7.55□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 BCAP29Q9UHQ4 241 aa7.55□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 ERVK-11Q9UQG0 969 aa7.55□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa7.55□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 DSPP15924 2871 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 A0A1W2PP18 115 aa7.54□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 CCDC154A6NI56 674 aa7.54□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 TTC36A6NLP5 189 aa7.54□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 ERVH48-1M5A8F1 160 aa7.54□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 COQ9O75208 318 aa7.54□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 SOX30O94993 753 aa7.54□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 PSMG1O95456 288 aa7.54□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 UQCRC2P22695 453 aa7.54□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 PPICP45877 212 aa7.54□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 TRPC1P48995 793 aa7.54□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 CDK9P50750 372 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 MLF1P58340 268 aa7.54□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 PSPHP78330 225 aa7.54□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 KLF10Q13118 480 aa7.54□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 DUSP8Q13202 625 aa7.54□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 MFAP5Q13361 173 aa7.54□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 RAPSNQ13702 412 aa7.54□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 EBPQ15125 230 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 TLR1Q15399 786 aa7.54□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 MAPKAPK3Q16644 382 aa7.54□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 SPDYE7PQ495Y7 208 aa7.54□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 PIGGQ5H8A4 983 aa7.54□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 ABHD17BQ5VST6 288 aa7.54□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa7.54□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 TCTN3Q6NUS6 607 aa7.54□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa7.54□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 IGFL2Q6UWQ7 119 aa7.54□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 IGFL3Q6UXB1 125 aa7.54□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 ANKRD46Q86W74 232 aa7.54□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 HPS6Q86YV9 775 aa7.54□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 C9orf40Q8IXQ3 194 aa7.54□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 CLECL1Q8IZS7 167 aa7.54□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 SLC15A4Q8N697 577 aa7.54□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 SIRT6Q8N6T7 355 aa7.54□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 TRIML2Q8N7C3 387 aa7.54□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 ZNF441Q8N8Z8 693 aa7.54□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 SIMC1Q8NDZ2 872 aa7.54□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 NUP43Q8NFH3 380 aa7.54□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 OR56A1Q8NGH5 318 aa7.54□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 OR4A15Q8NGL6 344 aa7.54□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 SFXN5Q8TD22 340 aa7.54□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 ADIPOR1Q96A54 375 aa7.54□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 VPS33AQ96AX1 596 aa7.54□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 SPDL1Q96EA4 605 aa7.54□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms