RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 MT3P25713 68 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 DPP4P27487 766 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 PTPN4P29074 926 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 CAPGP40121 348 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 HILS1P60008 231 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 NOP14P78316 857 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 LY6DQ14210 128 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 FAM182AQ5T1J6 154 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 LRRC8BQ6P9F7 803 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 P4HA3Q7Z4N8 544 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 BEST4Q8NFU0 473 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 MOCOSQ96EN8 888 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 GPA33Q99795 319 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 SEC14L4Q9UDX3 406 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 IKZF3Q9UKT9 509 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 EMCNQ9ULC0 261 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 CHMP2BQ9UQN3 213 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 NDUFAF8A1L188 74 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 H3BTX0 84 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 SOCS3O14543 225 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 OR9G9P0C7N8 305 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 NAAAQ02083 359 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 UNC50Q53HI1 259 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 Q6ZTC4 211 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 MOB2Q70IA6 237 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 CATSPER3Q86XQ3 398 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 ATF6BQ99941 703 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 CABLES2Q9BTV7 478 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 OCR1Q9BZK8 76 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 COG4Q9H9E3 785 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 NRN1Q9NPD7 142 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 GDAP2Q9NXN4 497 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 FZR1Q9UM11 496 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 K7EQG2 157 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 CHADO15335 359 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 APBB3O95704 486 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 POP4O95707 220 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 ECDO95905 644 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 CALCBP10092 127 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 DPEP1P16444 411 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 CYP2F1P24903 491 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 PPP2R1BP30154 601 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 AXLP30530 894 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 TRPC1P48995 793 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 SLC7A2P52569 658 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 PPIAP62937 165 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 IL9RQ01113 521 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 SRYQ05066 204 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 BNIP1Q12981 228 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF699Q32M78 642 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 ADPRMQ3LIE5 342 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 GFI1BQ5VTD9 330 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 CENPSQ8N2Z9 138 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 HSD17B14Q9BPX1 270 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 GPR174Q9BXC1 333 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 FOXJ3Q9UPW0 622 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 A0A0J9YVX5 310 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 A8MXK9 166 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 IDH1O75874 414 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 FCGR3AP08637 254 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 CYP11B1P15538 503 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 OXTRP30559 389 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 SPRP35270 261 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 TRIM23P36406 574 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 NAPAP54920 295 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 ATRAIDQ6UW56 229 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 CHCHD5Q9BSY4 110 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 APOOQ9BUR5 198 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 CARD6Q9BX69 1037 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 TUBB1Q9H4B7 451 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 RIBC2Q9H4K1 309 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 ALG9Q9H6U8 611 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 MDFICQ9P1T7 246 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 ATP6V1HQ9UI12 483 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 MUTYHQ9UIF7 546 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 FBXO7Q9Y3I1 522 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 A0A1B0GWJ7 208 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 H7C423 109 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 CA3P07451 260 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 PAICSP22234 425 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 SLC1A4P43007 532 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 RPAINQ86UA6 219 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF573Q86YE8 665 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 PHC2Q8IXK0 858 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 GCNT2Q8N0V5 402 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-212ENST00000491302 SSC4DQ8WTU2 575 aa6.3□□□□□ -1.4
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