RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489741.1

PRPF40A-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF40A, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-210ENST00000489741 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 MAPKAPK3Q16644 382 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 PPP1R3AQ16821 1122 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 DEFB134Q4QY38 66 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 SBSNQ6UWP8 590 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 SPNS3Q6ZMD2 512 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 LRRC8AQ8IWT6 810 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 MYO1HQ8N1T3 1032 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 MARVELD2Q8N4S9 558 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 PPM1NQ8N819 430 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 POGLUT1Q8NBL1 392 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 ANKRD7Q92527 254 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 LINGO1Q96FE5 620 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 H2AFJQ9BTM1 129 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 KLHL31Q9H511 634 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 PELI2Q9HAT8 420 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 NECTIN3Q9NQS3 549 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 ARL15Q9NXU5 204 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 JRKLQ9Y4A0 524 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 ITPR3Q14573 2671 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 NDUFS4O43181 175 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 PEX1O43933 1283 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 RNH1P13489 461 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 TFEBP19484 476 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 MAOAP21397 527 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 PTGER1P34995 402 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 ITGA8P53708 1063 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 SKP1P63208 163 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 OLR1P78380 273 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 CCZ1BP86790 482 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 CDKL1Q00532 357 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 RGS1Q08116 209 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 RUNX2Q13950 521 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 CSHL1Q14406 222 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 ADPRMQ3LIE5 342 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 CMPK2Q5EBM0 449 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 SPANXN3Q5MJ09 141 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 HECTD2Q5U5R9 776 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 STEAP4Q687X5 459 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF529Q6P280 563 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 PGM2L1Q6PCE3 622 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 ABHD13Q7L211 337 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 MDGA2Q7Z553 956 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 CA13Q8N1Q1 262 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 TRPV3Q8NET8 790 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 OR56A1Q8NGH5 318 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 LILRB4Q8NHJ6 448 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 FAM57AQ8TBR7 257 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 ACTRT1Q8TDG2 376 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC5A11Q8WWX8 675 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 ATL1Q8WXF7 558 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 SLCO2A1Q92959 643 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 QRFPRQ96P65 431 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 NEU1Q99519 415 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 NAT9Q9BTE0 207 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 SERHL2Q9H4I8 314 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 MANSC1Q9H8J5 431 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 MCCC2Q9HCC0 563 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 MMACHCQ9Y4U1 282 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 GTF3C1Q12789 2109 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 A0A1B0GTH9 108 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 LRIT2A6NDA9 550 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 URADA6NGE7 173 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 UNC119BA6NIH7 251 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 OVOL3O00110 214 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 CDC7O00311 574 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 CES2O00748 559 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 TP73O15350 636 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 BANF1O75531 89 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 TOXO94900 526 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 GUCA1CO95843 209 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 ABOP16442 354 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF24P17028 368 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 FPR1P21462 350 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC6A12P48065 614 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 CLCN2P51788 898 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 HSD17B7P56937 341 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 RAB8AP61006 207 aa5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms