RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, human

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCL20-204	ENST00000489160	SPANXN4	Q5MJ08	99 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CCL20-204	ENST00000489160	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CCL20-204	ENST00000489160	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CCL20-204	ENST00000489160	ZNF776	Q68DI1	518 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
CCL20-204	ENST00000489160	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CCL20-204	ENST00000489160	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
CCL20-204	ENST00000489160	TMEM64	Q6YI46	380 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CCL20-204	ENST00000489160	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CCL20-204	ENST00000489160	RFPL4B	Q6ZWI9	263 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CCL20-204	ENST00000489160	EFL1	Q7Z2Z2	1120 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
CCL20-204	ENST00000489160	SLC22A9	Q8IVM8	553 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CCL20-204	ENST00000489160	ELMOD1	Q8N336	334 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CCL20-204	ENST00000489160	BBOF1	Q8ND07	529 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CCL20-204	ENST00000489160	BHLHE23	Q8NDY6	225 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CCL20-204	ENST00000489160	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CCL20-204	ENST00000489160	OR4L1	Q8NH43	312 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CCL20-204	ENST00000489160	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CCL20-204	ENST00000489160	TMEM45B	Q96B21	275 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CCL20-204	ENST00000489160	BPIFA2	Q96DR5	249 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CCL20-204	ENST00000489160	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CCL20-204	ENST00000489160	PSKH2	Q96QS6	385 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CCL20-204	ENST00000489160	CCM2	Q9BSQ5	444 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CCL20-204	ENST00000489160	PKIB	Q9C010	78 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CCL20-204	ENST00000489160	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CCL20-204	ENST00000489160	B3GAT2	Q9NPZ5	323 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CCL20-204	ENST00000489160	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CCL20-204	ENST00000489160	DDX18	Q9NVP1	670 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
CCL20-204	ENST00000489160	ZNF490	Q9ULM2	529 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
CCL20-204	ENST00000489160	PLCL2	Q9UPR0	1127 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CCL20-204	ENST00000489160	MRPS33	Q9Y291	106 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
CCL20-204	ENST00000489160	NSD2	O96028	1365 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CCL20-204	ENST00000489160	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		4.21	□□□□□ -1.73
CCL20-204	ENST00000489160	PTCH1	Q13635	1447 aa		4.21	□□□□□ -1.73
CCL20-204	ENST00000489160	IQCM	A0A1B0GVH7	501 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CCL20-204	ENST00000489160	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CCL20-204	ENST00000489160	MPTX1	A8MV57	137 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CCL20-204	ENST00000489160	NPIPB9	F8W1W9	429 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CCL20-204	ENST00000489160	ZNF208	O43345	1280 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CCL20-204	ENST00000489160	B4GALT2	O60909	372 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CCL20-204	ENST00000489160	ANP32D	O95626	131 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CCL20-204	ENST00000489160	MBD3	O95983	291 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CCL20-204	ENST00000489160	CT45A8	P0DMV1	189 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CCL20-204	ENST00000489160	CT45A9	P0DMV2	189 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CCL20-204	ENST00000489160	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
CCL20-204	ENST00000489160	FCAR	P24071	287 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CCL20-204	ENST00000489160	EDNRA	P25101	427 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CCL20-204	ENST00000489160	CBX1	P83916	185 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CCL20-204	ENST00000489160	GPR50	Q13585	617 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CCL20-204	ENST00000489160	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	4.21	□□□□□ -1.74
CCL20-204	ENST00000489160	CT45A2	Q5DJT8	189 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CCL20-204	ENST00000489160	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CCL20-204	ENST00000489160	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CCL20-204	ENST00000489160		Q6ZVQ6	151 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CCL20-204	ENST00000489160	CYP4V2	Q6ZWL3	525 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
CCL20-204	ENST00000489160	VPS36	Q86VN1	386 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CCL20-204	ENST00000489160	GRAMD2A	Q8IUY3	354 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CCL20-204	ENST00000489160	UBQLNL	Q8IYU4	475 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CCL20-204	ENST00000489160	DND1	Q8IYX4	353 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
CCL20-204	ENST00000489160	CCDC197	Q8NCU1	140 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CCL20-204	ENST00000489160	RPLP0P6	Q8NHW5	317 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CCL20-204	ENST00000489160	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
CCL20-204	ENST00000489160	TCP11	Q8WWU5	503 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CCL20-204	ENST00000489160	SLC35C1	Q96A29	364 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CCL20-204	ENST00000489160	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
CCL20-204	ENST00000489160	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CCL20-204	ENST00000489160	C4orf36	Q96KX1	117 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CCL20-204	ENST00000489160	S1PR3	Q99500	378 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CCL20-204	ENST00000489160	PAPOLG	Q9BWT3	736 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
CCL20-204	ENST00000489160	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CCL20-204	ENST00000489160	SLC26A1	Q9H2B4	701 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CCL20-204	ENST00000489160	C3orf14	Q9HBI5	128 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CCL20-204	ENST00000489160	TEX10	Q9NXF1	929 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
CCL20-204	ENST00000489160	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CCL20-204	ENST00000489160	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CCL20-204	ENST00000489160	RNF14	Q9UBS8	474 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CCL20-204	ENST00000489160	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CCL20-204	ENST00000489160	OR10H1	Q9Y4A9	318 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CCL20-204	ENST00000489160	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
CCL20-204	ENST00000489160	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CCL20-204	ENST00000489160	GSAP	A4D1B5	854 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CCL20-204	ENST00000489160	ERICH4	A6NGS2	130 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CCL20-204	ENST00000489160	GLTPD2	A6NH11	291 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CCL20-204	ENST00000489160	SERINC4	A6NH21	518 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CCL20-204	ENST00000489160	LMO7DN	F2Z398	122 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CCL20-204	ENST00000489160	BUB1	O43683	1085 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CCL20-204	ENST00000489160	LRCH4	O75427	683 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CCL20-204	ENST00000489160	WBP4	O75554	376 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
CCL20-204	ENST00000489160	MTRF1	O75570	445 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
CCL20-204	ENST00000489160	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
CCL20-204	ENST00000489160	RPLP0	P05388	317 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
CCL20-204	ENST00000489160	IQCF3	P0C7M6	154 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CCL20-204	ENST00000489160	GP9	P14770	177 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CCL20-204	ENST00000489160	ACKR3	P25106	362 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CCL20-204	ENST00000489160	PTPN6	P29350	595 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CCL20-204	ENST00000489160	PDHA2	P29803	388 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CCL20-204	ENST00000489160	GPR183	P32249	361 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CCL20-204	ENST00000489160	TMEM50B	P56557	158 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CCL20-204	ENST00000489160	BTG1	P62324	171 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CCL20-204	ENST00000489160	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
CCL20-204	ENST00000489160	DHODH	Q02127	395 aa		4.2	□□□□□ -1.74

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