RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487288.1

TAF6-215, Transcript of TATA-box binding protein associated factor 6, human

TSL 5

Gene TAF6, Length 1,195 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TAF6-215	ENST00000487288	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	IL2RA	P01589	272 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	ABCB1	P08183	1280 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	NT5E	P21589	574 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	PTPN6	P29350	595 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	TYK2	P29597	1187 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	PEX19	P40855	299 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	PTGDS	P41222	190 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	SLCO1A2	P46721	670 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	NAGLU	P54802	743 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	SLC7A5	Q01650	507 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	DUSP2	Q05923	314 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	NNAT	Q16517	81 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	FRG2	Q64ET8	278 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	TIGD3	Q6B0B8	471 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	METTL2B	Q6P1Q9	378 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	RPS27L	Q71UM5	84 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	PM20D2	Q8IYS1	436 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	CHDH	Q8NE62	594 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	C17orf47	Q8NEP4	570 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	OR7G1	Q8NGA0	311 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	HGD	Q93099	445 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	FRG2B	Q96QU4	278 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	TRIB1	Q96RU8	372 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	NODAL	Q96S42	347 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	NTMT1	Q9BV86	223 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	VPS11	Q9H270	941 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	FARSB	Q9NSD9	589 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	PCTP	Q9UKL6	214 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	PCDHA9	Q9Y5H5	950 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	CD8B2	A6NJW9	211 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	PPP6C	O00743	305 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	PPM1B	O75688	479 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	POR	P16435	677 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	ARL1	P40616	181 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	MAGEA12	P43365	314 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	TMED10	P49755	219 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	SERPINB8	P50452	374 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	CCNG1	P51959	295 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	NRG3	P56975	720 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	EXOSC7	Q15024	291 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	TOMM20	Q15388	145 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	PRICKLE4	Q2TBC4	344 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	SGO1	Q5FBB7	561 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	CCNYL2	Q5T2Q4	361 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	FAM180B	Q6P0A1	224 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	KLC3	Q6P597	504 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	ANGPTL8	Q6UXH0	198 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	YRDC	Q86U90	279 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	METTL4	Q8N3J2	472 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	FAM83F	Q8NEG4	500 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	GOT1L1	Q8NHS2	421 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	LINC01560	Q8TB33	94 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	ABTB1	Q969K4	478 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	ATP6V1E2	Q96A05	226 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	HSPBAP1	Q96EW2	488 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	ITPA	Q9BY32	194 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	DLL4	Q9NR61	685 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	NINJ2	Q9NZG7	142 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	MAT2B	Q9NZL9	334 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	JKAMP	Q9P055	326 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	ZNF639	Q9UID6	485 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	ADAM29	Q9UKF5	820 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	STX16-NPEPL1	H3BU86	382 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	STX16	O14662	325 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	ICOSLG	O75144	302 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	EPX	P11678	715 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	DNASE1	P24855	282 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	CTSS	P25774	331 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	FEN1	P39748	380 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	MAP4K2	Q12851	820 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	FOXF2	Q12947	444 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	SLC48A1	Q6P1K1	146 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	TMEM81	Q6P7N7	255 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	PAMR1	Q6UXH9	720 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	COMMD6	Q7Z4G1	85 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	VWA5B2	Q8N398	1253 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	ADCY4	Q8NFM4	1077 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	OR4F6	Q8NGB9	312 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	OR1J4	Q8NGS1	313 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	ISL2	Q96A47	359 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	TM4SF18	Q96CE8	201 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	BRINP2	Q9C0B6	783 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	CALHM2	Q9HA72	323 aa		13.55	□□□□□ -0.24

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