RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 ADIPOR1Q96A54 375 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 HSPBAP1Q96EW2 488 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 GNRHR2Q96P88 292 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 PRODH2Q9UF12 536 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 CAMK2AQ9UQM7 478 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 EXPH5Q8NEV8 1989 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 PDZD2O15018 2839 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 FBN2P35556 2912 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 A8MT66 165 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 SUPT7LO94864 414 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 ATP1B1P05026 303 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 NAGAP17050 411 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 GPX3P22352 226 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 ABCD3P28288 659 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 CASP3P42574 277 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 CLCQ05315 142 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 MAP4K2Q12851 820 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 NNATQ16517 81 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 BICRALQ6AI39 1079 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 LETMD1Q6P1Q0 360 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 NUP54Q7Z3B4 507 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 LACC1Q8IV20 430 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 OR1J4Q8NGS1 313 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 TMEM41AQ96HV5 264 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 TIMP4Q99727 224 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 VPS29Q9UBQ0 182 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 C15orf41Q9Y2V0 281 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 GNB5O14775 395 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 PPM1BO75688 479 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 OR4F21O95013 312 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 EPPINO95925 133 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 HPNP05981 417 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 HSD3B1P14060 373 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 CD1EP15812 388 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 BMP5P22003 454 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 HSD3B2P26439 372 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 HMOX2P30519 316 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 KIR2DL3P43628 341 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 CDK9P50750 372 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 DCAF7P61962 342 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 PLCXD2Q0VAA5 305 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 RASA2Q15283 850 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 FAM111BQ6SJ93 734 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 TM4SF18Q96CE8 201 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 MTBPQ96DY7 904 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 DTNBP1Q96EV8 351 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 ITPAQ9BY32 194 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 KLRF1Q9NZS2 232 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 NFU1Q9UMS0 254 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 EDARQ9UNE0 448 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 STK38LQ9Y2H1 464 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 SLC6A5Q9Y345 797 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 CCDC151A5D8V7 595 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 ACOX3O15254 700 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 RIPPLY3P57055 190 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 RCAN2Q14206 197 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 SLC30A6Q6NXT4 461 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 ZZZ3Q8IYH5 903 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 CDYL2Q8N8U2 506 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 ADCY4Q8NFM4 1077 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 OMA1Q96E52 524 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 HBEGFQ99075 208 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 GIMAP4Q9NUV9 329 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 MAT2BQ9NZL9 334 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 UTS2RQ9UKP6 389 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 L3MBTL1Q9Y468 752 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa18.43■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 ULK1O75385 1050 aa18.43■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 TIMP3P35625 211 aa18.43■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 HSD17B3P37058 310 aa18.43■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 ASCL1P50553 236 aa18.43■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 TIGD3Q6B0B8 471 aa18.43■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 SPNS3Q6ZMD2 512 aa18.43■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa18.43■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 LCA5Q86VQ0 697 aa18.43■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 OR52R1Q8NGF1 315 aa18.43■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 METTL6Q8TCB7 284 aa18.43■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 TRIB1Q96RU8 372 aa18.43■□□□□ 0.54
ACTB-212ENST00000484841 OSBPL11Q9BXB4 747 aa18.43■□□□□ 0.54
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