RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468371.5

SHQ1-205, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SHQ1, Length 4,024 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-205ENST00000468371 SPARTQ8N0X7 666 aa5.67□□□□□ -1.5
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SHQ1-205ENST00000468371 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa5.67□□□□□ -1.5
SHQ1-205ENST00000468371 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
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SHQ1-205ENST00000468371 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-205ENST00000468371 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-205ENST00000468371 CREBBPQ92793 2442 aa5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-205ENST00000468371 HYKKA2RU49 373 aa5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-205ENST00000468371 C21orf140B9A014 251 aa5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-205ENST00000468371 H0YAE9 185 aa5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-205ENST00000468371 NKX2-8O15522 239 aa5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-205ENST00000468371 CREG1O75629 220 aa5.66□□□□□ -1.5
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