RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459758.5

TTLL3-222, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 555 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-222	ENST00000459758	HYKK	A2RU49	373 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	ISPD	A4D126	451 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	TTC36	A6NLP5	189 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	CCRL2	O00421	344 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	LAT	O43561	262 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	ADAM23	O75077	832 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	NADK	O95544	446 aa	Predicted RBP	10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	EGF	P01133	1207 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	GAST	P01350	101 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	IGLV3-19	P01714	112 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	C1QC	P02747	245 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	FUCA1	P04066	466 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	GUSB	P08236	651 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	MAT2A	P31153	395 aa	Known RBP	10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	MASP1	P48740	699 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	BMX	P51813	675 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	CASP9	P55211	416 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	LIM2	P55344	173 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	TAS2R41	P59536	307 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	BTN3A2	P78410	334 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	TARDBP	Q13148	414 aa	Known RBP eCLIP	10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	IRF3	Q14653	427 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	PRSS53	Q2L4Q9	553 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF311	Q5JNZ3	666 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	ENTPD8	Q5MY95	495 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	RPL13AP3	Q6NVV1	102 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	C1orf94	Q6P1W5	598 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	USP53	Q70EK8	1073 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	RANBP3L	Q86VV4	465 aa	Predicted RBP	10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC43A2	Q8N370	569 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM26E	Q8N5C1	309 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	GALNT6	Q8NCL4	622 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	GPR32P1	Q8NGA4	272 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	OR4E2	Q8NGC2	313 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	OR1E3	Q8WZA6	343 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	RAB8B	Q92930	207 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	RFK	Q969G6	155 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	CNRIP1	Q96F85	164 aa	Predicted RBP	10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	TMEM80	Q96HE8	168 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	OR7D2	Q96RA2	312 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	FZD3	Q9NPG1	666 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	MED17	Q9NVC6	651 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	C14orf105	Q9NVL8	296 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF226	Q9NYT6	803 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	NLGN3	Q9NZ94	848 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	CRNN	Q9UBG3	495 aa	Predicted RBP	10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	FBXW2	Q9UKT8	454 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	PNMA8B	Q9ULN7	279 aa	Predicted RBP	10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	SATB2	Q9UPW6	733 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	ATG4B	Q9Y4P1	393 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-222	ENST00000459758	TMEM131	Q92545	1883 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-222	ENST00000459758		A0A0J9YY10	115 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-222	ENST00000459758		J3KTA2	159 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-222	ENST00000459758	LINC01565	O15544	149 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-222	ENST00000459758	COQ9	O75208	318 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-222	ENST00000459758	OR5F1	O95221	314 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-222	ENST00000459758	SEMA4F	O95754	770 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-222	ENST00000459758	CCNYL3	P0C7X3	344 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-222	ENST00000459758	TNFRSF1B	P20333	461 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-222	ENST00000459758	CERS1	P27544	350 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-222	ENST00000459758	PEBP1	P30086	187 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-222	ENST00000459758	CNR2	P34972	360 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-222	ENST00000459758	MAP2K4	P45985	399 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-222	ENST00000459758	SOX9	P48436	509 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-222	ENST00000459758	PRKAG1	P54619	331 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-222	ENST00000459758	RPS26	P62854	115 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF45	Q02386	682 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-222	ENST00000459758	BIK	Q13323	160 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-222	ENST00000459758	SPCS2	Q15005	226 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-222	ENST00000459758	SYPL1	Q16563	259 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF404	Q494X3	552 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-222	ENST00000459758	PRRT3	Q5FWE3	981 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-222	ENST00000459758	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-222	ENST00000459758	MFSD4B	Q5TF39	518 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-222	ENST00000459758	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-222	ENST00000459758	FIGLA	Q6QHK4	219 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-222	ENST00000459758		Q6ZNX1	250 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-222	ENST00000459758	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-222	ENST00000459758	CCDC71	Q8IV32	467 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-222	ENST00000459758	CCDC116	Q8IYX3	515 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-222	ENST00000459758	MMP21	Q8N119	569 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-222	ENST00000459758	FBXL6	Q8N531	539 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-222	ENST00000459758	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-222	ENST00000459758	B3GNT7	Q8NFL0	401 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-222	ENST00000459758	PIGX	Q8TBF5	258 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-222	ENST00000459758	CHPT1	Q8WUD6	406 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-222	ENST00000459758	OSTF1	Q92882	214 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-222	ENST00000459758	DACH2	Q96NX9	599 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-222	ENST00000459758	CSF3R	Q99062	836 aa		10.83	□□□□□ -0.68

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